郊游的离群值:战略匹配致癌基因亚型的前列腺癌

一项新的研究揭示了一个未知的候选癌基因似乎扮演了一个重要的角色在前列腺癌的一个子集。这项研究由细胞出版社出版的杂志6月刊癌症细胞,描述了一种新的策略,可以用来发现“异常值”基因在癌症亚型,不清楚。

“我们知道,ETS基因融合发生在40% - -80%的前列腺特异性抗原(PSA)筛查前列腺癌,留下20% - -60%的前列腺癌基因畸变的关键是未知的。此外,我们已经表明,ETS-positive和消极的癌症有明显的转录签名,表明独特的致癌基因和下游目标在fusion-negative癌症中发挥作用,”主要作者解释说,博士Arul m . Chinnaiyan来自密歇根大学的医学院。

Chinnaiyan博士和他的同事们找到了致癌基因驱动ETS-negative前列腺癌使用新开发方法的改良版,癌症离群值(国王),概要分析,识别异常值致癌基因的特定子集癌症病例。使用这种方法从七前列腺癌检查数据分析研究中,他们发现了SPINK1(丝氨酸肽酶抑制剂,Kazal类型1)体内的过表达在前列腺癌和良性前列腺细胞相比,显示与ETS家族成员相互排斥的过度。

SPINK1异常表达可能是体内检测到尿液中无创和SPINK1局外人体内表达被证明是一种有效的手术切除后前列腺癌复发的独立预测指标。此外,积极ETS-negative 22 rv1细胞系被认定为SPINK1局外人体内表达模型。减少SPINK1在这些细胞可以降低体内入侵,建议SPINK1 ETS-negative前列腺癌在体内的功能作用。

这些结果确定SPINK1作为生物体内特定于激进ETS-negative前列腺癌的一个子集。还需要进一步的研究来确定SPINK1是体内的机制在ETS-negative癌症。“我们的研究也扩展了原来的国王杯的效用的方法通过使用meta-COPA策略提名候选癌基因在特定类型的癌症,”Chinnaiyan博士总结道。

来源:细胞出版社