癌症测序项目识别潜在的方法对抗激进的白血病

研究人员发现,白血病的预后较差的子类型是由于突变通道明显不同于一个看似类似白血病与一个更好的结果。st . Jude儿童研究医院的结果——华盛顿大学的儿科癌症基因组项目(PCGP)突出一个可能的新策略,这更激进的癌症患者。

工作提供了第一个基因改变的细节引发亚型急性淋巴细胞白血病(ALL)被称为早期t细胞前体(ETP-ALL)。结果显示ETP-ALL有更多的共同点与急性髓系白血病(AML)与其他亚型。这项研究发表在《华尔街日报》1月12日版自然。

都是最常见的儿童癌症,约有12%的患者t。所有来自T-lineage白细胞组成免疫系统的一个分支。ETP-ALL被圣裘德的研究人员发现,约占12%的t细胞。许多ETP-ALL患者无法应对目前的治疗和从未进入缓解期。只有30 - 40%的病人成为长期的幸存者,大约80%的儿童相比,与其他所有亚型。

”我们发现的突变和基因表达谱在这项研究表明患者ETP-ALL可能从治疗中获益,其中包括药物为治疗急性髓系白血病,开发“查尔斯Mullighan说,医学博士博士,助理的圣裘德病理学和相对应的研究的作者之一。

Mullighan说ETP-ALL夹杂物的选择儿科癌症基因组计划由于结果不佳,缺乏信息的遗传病变过程中积极亚型白血病。“圣裘德是一个先锋增加整体存活率,为圣裘德病人今天超过90%。现在我们正在对类似的进步在这种罕见的疾病,”他说。

人类基因组是组装所需的完整的指令集和维持人的生命。白血病和其他癌症发展当正常细胞基因组中积累的突变导致的不受控制的细胞生长是癌症的一个特点。三年的儿科癌症基因组计划是肿瘤细胞的基因组测序和匹配正常DNA样本600名儿童的一些最鲜为人知的和侵略性的癌症。调查人员认为这些发现将下一代的临床的基础工具。

在这项研究中,正常和癌症基因组的测序和分析人员12圣裘德ETP-ALL患者。调查人员然后检查一些相同的突变一个额外的94名年轻白血病ETP-ALL或其他类型的患者t细胞。

“我们发现突变的ETP-ALL中未见其他形式的,”作者理查德·威尔逊说:博士,华盛顿大学基因组研究所的主任。“结果提供新的治疗靶点和使用基因测试来确定ETP-ALL病人早期和标记他们更积极的治疗。”

突变的模式识别在ETP-ALL想起变化与AML, Mullighan说。细胞因子受体的变化集中在基因和RAS信号通路参与癌症的类型的细胞调节中断。FLT3突变,其中包括国家管制当局方面,JAK3, IL7R和其他基因,在大约67%的患者被发现ETP-ALL,但只有19%的其他所有的病人。

此外,突变基因已知或预测破坏血液干细胞或淋巴细胞的正常发展中确定ETP-ALL患者的58%,但只有17%的其他所有的病人。受影响的基因包括ETV6 RUNX1、IKZF1 GATA3。GATA3帮助调节T细胞的早期发展,和突变基因被发现只在ETP-ALL病人。

表观遗传变异,基因改变的影响,间接影响其他基因的活性,在ETP-ALL病人也更常见。包括EZH2和SUZ12,这些基因突变或删除在ETP-ALL患者的45%,但只有11%的对照组。目标基因修改蛋白质被称为组蛋白,通过DNA结合控制基因活动。

研究还表明,ETP-ALL包括重复基因突变在大约六个以前未与血液癌症。包括基因RELN和DNM2列表。”的模式突变我们发现在这些基因表明他们作为肿瘤抑制和他们的损失导致发展中血液细胞的恶性转化,”Mullighan说。

Mullighan说正在合作开发实验室模型的人类ETP-ALL AML和使用这些模型来确定最有可能受益ETP-ALL病人的药物。的列表可能的药物包括大剂量阿糖胞苷和靶向化疗药物抑制细胞因子受体的活动和木菠萝信号通路在ETP-ALL发现在这项研究中被破坏病人,研究人员说。这些途径帮助调节细胞分裂和血液系统的正常发展。

“这是第一个的一系列重大发现童年癌症的基因基础上新兴的儿科癌症基因组项目,按时完全序列600儿童癌症基因组到2013年,“威廉·e·埃文斯博士说,圣裘德董事兼首席执行官。詹姆斯·唐宁,医学博士圣裘德科学主任,圣裘德PCGP网站领导和该研究的通讯作者,补充说:“这项研究强调基因组计划是如何产生新的见解的遗传改变背后的一些最激进的童年癌症,反过来我们指向新的治疗选择,可能会增加儿童的存活率与这些癌症。”

另一个PCGP研究进步了解恶性肿瘤儿童眼睛视网膜母细胞瘤的遗传学基础将出现在1月11日在线版自然。这两项研究的数据免费向调查人员在PCGP探索网站,可以访问http://explore.pediatriccancergenomeproject.org。