开发的方法是为了实现患者血液样本的疟疾寄生虫基因组的大规模分析
研究人员开发了一种新技术来鉴定疟疾寄生虫进化的热点，并比以往任何时候都更快，更有效地跟踪疟疾耐药性的兴起。
研究人员第一次有能力分析疟疾使用新的患者血液样本直接从患者血液样本中测序技术和信息学方法。作为原则的证明，该小组对六个国家的临床样本进行了首次分析，并发现了非洲，亚洲和大洋洲的疟疾发展的独特差异。这项研究发表在自然2012年6月13日。
严重的形式疟疾感染是由寄生虫引起的恶性疟原虫，这是由蚊子传播的。疟疾感染了超过2亿人，每年大约有60万人丧生，主要是撒哈拉以南非洲五岁以下的儿童。
“最引人注目的功能之一恶性疟原虫它的能力是进化和克服抗疟疾药物的能力。氯喹对疟疾的有效无效，对其他一线药物的抵抗力正在出现。能够监测恶性疟原虫并确定潜在阻力发生的热点。从感染者的血液中快速对寄生虫基因组进行快速测序是检测寄生虫种群变化的有力方法，并且可能是一个重要的新方法监视工具在控制疟疾的武术中。”
该小组开发了一种新技术，可以直接从样品中去除尽可能多的人类DNA的血液中提取寄生虫DNA。新方法克服了在测序之前在血液培养中种植寄生虫的需求，加快了过程并最大程度地减少了复制误差。
恶性疟原虫基因组特别困难，因为与人DNA，重复DNA序列的大部分。结果，使用当前的DNA测序方法，整个寄生虫基因组DNA序列的重建缓慢，昂贵且容易出错。为了避免这些问题，该团队使用序列数据创建了单个DNA字母更改的列表，称为SNP，可以在基因组的基因丰富区域可靠地识别。这些SNP允许发现和测量自然寄生虫种群的变异性。
“我们在寄生虫基因组中分类了大约86,000个SNP，这使我们能够确定之间的差异寄生虫在世界各地，了解这些人群如何适应环境变化的起点。
桑格学院（Sanger Institute）和牛津大学（Oxford University）的奥利沃·米托（Olivo Miotto）博士也是一名联合首先作者，他补充说：“许多疟疾患者，尤其是在非洲的疟疾患者，不断受到疟疾的寄生虫感染，我们创建了一种新工具来研究研究遗传多样性在单个患者中，并将其与环境中的多样性进行比较。”
该团队使用这些技术来分析布基纳法索，柬埔寨，肯尼亚，马里，巴布亚新几内亚和泰国的样品。他们发现，一个受感染的人可以怀有许多遗传上不同的疟疾寄生虫，从而使寄生虫种群可以交换DNA创建新形式。因此，寄生虫进化的速度受到人为因素和地理的巨大影响。
来自布基纳法索和马里的邻国非洲国家中的样本，那里有很高的疟疾传播，显示出强烈的交织恶性疟原虫基因组。
与之形成鲜明对比的是亚洲恶性疟原虫收集在泰国河畔边境的寄生虫不仅与非洲的寄生虫不同，而且与柬埔寨泰国边界附近的寄生虫不同。缺乏混杂的可能是泰国有效控制疟疾的结果，再加上泰国和柬埔寨之间人民旅行的历史。
“反疟疾的出现和传播耐药性牛津大学和泰国玛希多大学的尼克·怀特（Nick White）教授说，这是对当前全球倡议的主要威胁。“这项研究提供了对疟原虫的种群结构和进化的基本见解，如果我们要识别我们必须识别的话，这是必不可少的。，映射，然后包含扩散电阻。作为一个全球社区的工作，我们现在可以基于这种技术来识别世界各地抗疟疾耐药性的热点，并有效地遏制它们。”
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