表观基因组异常预测非霍奇金淋巴瘤患者的生存
可以把表观基因组想象成一个巨大的音乐混音板,打开或关闭各种基因的表达。科罗拉多大学癌症中心的一项研究今天发表在该杂志上公共科学图书馆遗传学研究表明,在癌症中,不仅基因本身会变坏,表观遗传混合板的异常变化也会不幸地改变这些基因的表达。研究人员希望扮演声音工程师的角色,控制这些有害的表观基因组变化来抑制癌症本身,或者可能使癌症对现有药物敏感。
表观基因组的主要工具——也是迄今为止最容易研究的工具——是甲基化:它附着的很少甲基至DNA序列在基因附近沉默或促进他们的表情。
“我们不仅在非霍奇金属中看到更异常的甲基化淋巴瘤患者比健康的B-要好细胞群体,但诊所有三种不同的疾病亚型,每个疾病都比下一个更具侵略性。这三个临床轨迹非霍奇金淋巴瘤患者的甲基化水平异常明显,”加州大学癌症中心研究员、加州大学医学院助理教授Subhajyoti De博士说。
换句话说,甲基化模式预测了患者的生存。它是这样工作的:
DNA应以一致的方式甲基化 - 您可以获得一定的标准化量的甲基“残留物”。果然,这就是健康B细胞的情况。Subhajyoti和同事表明,在癌症B细胞中,水平DNA甲基化从细胞到细胞变化繁重。而且越来越疯狂的DNA甲基化水平变化,癌症越多。就好像在体内,你想要一个保持一致的外延蛋白酶,其保持健康状况的甲基化 - 当一个威利 - 尼利表象组随机滴下甲基化时,它促进了非正常细胞,如癌症。
因此,异常的甲基化肯定与癌症不仅与癌症相似,而且与癌症亚型的激进的行为相关。但是这种甲基化的功能作用究竟是什么?
“我们认为除了引起癌症的遗传突变,表观遗传变化可能发挥着一种微妙的作用,允许癌症在我们的身体内茁壮成长,”Subhajyoti说。
有些药物会影响表观基因组的甲基化能力,从而控制基因——有些药物会全面增加或减少甲基化程度,有些药物会影响某些遗传产物的甲基化程度。这些药物中是否有一种是使癌症发生突变的关键?
Subhajyoti希望了解。
“在过去的50年里,科学界推力了识别癌症的遗传驱动因素,但现在在过去的五到六年中,我们也将搜索扩展到了表观群组中,”Subhajyoti说。“我们现在期望发现遗传和表观遗传异常都对于癌症的启动和维持是重要的。”
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