整个基因组测序发现大多数脑肿瘤亚型的新突变归咎于
华盛顿大学儿科癌症基因组项目已经确定了导致一半以上儿童脑肿瘤亚型的突变，这对患者造成了很大的伤害。研究人员还发现，肿瘤容易受到开发的药物的影响。
该研究的重点是脑部肿瘤称为低级神经胶质瘤（LGGS）。这些缓慢的癌症每年在美国大约700名儿童中发现，使其成为大脑和脊髓中最常见的儿童肿瘤。对于无法通过手术切除肿瘤的患者，由于疾病及其持续治疗的并发症，长期前景仍然黯淡。在全国范围内，仅手术仅治愈约三分之一的患者。
使用整个基因组测序研究人员确定了在称为弥漫性LGG的LGG亚型中几乎完全发生的两个基因中的遗传改变。该亚型不能通过手术治愈肿瘤细胞入侵健康的大脑。在这项研究中，该突变占弥漫性LGG的53％。研究人员还表明，以前尚未与脑肿瘤相关的突变之一引入胶质时会导致肿瘤脑细胞老鼠。
这些发现出现在4月14日的《科学杂志》预先在线版本中自然遗传学。
圣裘德病理学系主席David Ellison博士说：“低级神经胶质瘤的这种亚型可能是一种令人讨厌的慢性疾病，但是在这项研究之前，我们几乎对其遗传改变一无所知。”和研究的对应作者。第一作者是Jinghui Zhang博士，他是圣裘德部的副成员计算生物学。
小儿癌症基因组项目正在使用下一代基因组测序为了确定儿童和青少年的完全正常和癌症基因组，其中一些知识最少，最难治疗的癌症。科学家认为，研究构成人类基因组的30亿化学基础的差异将为下一代癌症护理提供科学基础。
圣路易斯华盛顿大学医学院基因组研究所主任理查德·威尔逊（Richard K.D.）合着者理查德·威尔逊（Richard K.D.。“这是一条主要的途径，低级神经胶质瘤通过它，为我们寻找更好的治疗方法提供了新的线索。”
该研究涉及来自38个成对的肿瘤和正常组织样品的整个基因组测序，来自38名儿童和青少年，具有不同亚型的LGG和相关肿瘤，称为低级Glioneuronal肿瘤（LGGNTS）。尽管许多癌症在多种遗传异常之后发展，但这项研究中39个肿瘤中有62％源于单个遗传改变。
先前的研究已将LGG与MAPK/ERK途径的异常激活联系起来。该途径参与调节细胞分裂和其他经常被癌症中断的过程。到目前为止，遗传改变在某些类型的LGG和LGGNT中，驾驶此途径涉及该路径是未知的。
这项研究将激活与FGFR1基因的关键片段的复制有关，研究人员首次在脑肿瘤中发现了激活。该段称为酪氨酸激酶结构域。它的功能就像多个单元信号通路（包括MAPK/ERK途径）的开关开关一样。研究人员还证明，旨在阻止在具有FGFR1酪氨酸激酶结构域重复的细胞中工作的两种变化途径的活性的实验药物。埃里森说：“这一发现表明，在无法通过手术切除肿瘤的患者中使用靶向疗法的潜在机会。”
研究人员还表明，FGFR1异常触发了缺乏小鼠的神经胶质细胞的侵袭性脑肿瘤瘤抑制基因TRP53。
全基因组测序在MYB和MYBL1基因中发现了以前未被发现的重排。这些新确定的异常也涉及开启MAPK/ERK途径。
研究人员还检查了相同的FGFR1，MYB和MYBL1突变的100个LGG和LGGNT。总体而言，MYB在25％的弥漫性LGG中发生了变化，而24％的MYB在FGFR1中发生了变化。研究人员还出现了仅在几个肿瘤中发生的许多其他突变。受影响的基因包括BRAF，RAF1，H3F3A，ATRX，EP300，WHSC1和CHD2。
“这小儿癌基因组项目为研究这种疾病的基因组景观提供了一个非凡的机会，并确实在地图上进行了改变。现在，我们可以解决造成90％以上低级神经胶质瘤的遗传错误，” Ellison说：“发现FGFR1和MYB在儿童期弥漫性LGG中起着核心作用，也可以区分儿科和成人形式。疾病。”
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