基因组测序提供了前所未有的洞察力肺炎球菌病的原因
领导的一个新的研究人员来自哈佛公共卫生学院(HSPH)和英国威康基金会桑格研究所,第一次使用基因组测序技术来追踪细菌数量的变化,推出一种疫苗。肺炎球菌细菌的研究遵循人口如何改变后的引入Prevnar共轭多糖疫苗,大大降低利率的肺炎球菌病在美国的工作表明,这项技术可以用于未来的监测预防接种或抗生素使用的有效性不同种类的细菌病原体,和描述新出现的威胁。
这项研究发表在线5月5日,2013年自然遗传学。
“这给了前所未有的洞察力细菌生活和传输在我们中间,”作者威廉•Hanage说:哈佛公共卫生学院流行病学副教授。“我们可以描述这些bug了几乎难以想象的程度的细节,这样更好的了解甚至帮助他们生存的一个有效的疫苗。”
肺炎球菌病是由一种细菌引起的链球菌引起的肺炎,它存在于许多人的鼻子和喉咙,传播通过咳嗽,打喷嚏,或其他接触呼吸道分泌物。使它成为致病的情况下是不能完全理解。的肺炎球菌疾病和感染,可导致肺炎、脑膜炎和其他illnesses-dropped幼儿在2000年推出一种疫苗。然而,菌株的细菌疫苗迅速增加,没有针对性耐药性似乎在上升。
调查人员领导的研究,文章的第二作者Hanage;流行病学教授Marc Lipsitch;和斯蒂芬·宾利,维尔康姆基金会桑格研究所的资深科学家,旨在更好地理解细菌种群对疫苗的反应。全基因组sequencing-which揭示了DNA编码每个菌株空前的细节是用于研究的样本616肺炎双球菌收集了从2001年到2007年在马萨诸塞州的社区。
本研究确认的部分细菌的数量有针对性的疫苗几乎消失了,令人惊讶的是,透露,他们已经被预先存在的罕见类型的细菌。的遗传组成新的人口非常类似于原始的,除了几所直接影响的基因疫苗。这个小的基因改变似乎是负责大减少肺炎球菌病的几率。
“全基因组测序的广泛使用将允许更好的监测细菌populations-even那些基因多样性和提高认识的进化,“说Lipsitch说道。“在这项研究中,我们甚至能看到这些细菌之间的传输速度不同地区在马萨诸塞州和识别基因与细菌在不同年龄的儿童。”
“未来,我们将能够实时监控进化。如果我们能更快更准确地跟踪致病细菌的出现,我们就可以更有针对性的干预措施限制的疾病负担,”本特利说。
