细菌的DNA可能更容易融入人类基因在肿瘤组织中

细菌的DNA可能更容易融入人类基因组在肿瘤比在正常的人体组织,根据一项新的研究从马里兰大学医学院的基因组科学研究所。研究人员分析了基因组测序数据可以从人类基因组计划,1000人基因工程和癌症基因组图谱(TCGA)。他们认为横向基因转移的现象(LGT),遗传物质在生物体之间的传播性的缺失。

科学家已经证明,细菌可以转移DNA基因组的一种动物。马里兰大学的研究所的研究人员基因组科学发现的证据表明,横向基因转移有可能从细菌到人类身体的细胞,被称为人类体细胞。他们发现细菌的DNA更有可能的肿瘤样本的基因组中整合比正常,健康的体细胞。这一现象可能发挥作用在癌症和其他疾病相关DNA损伤。论文发表PLOS计算生物学6月20日。

“LGT从细菌到动物只是描述最近,这是令人兴奋的发现,这种转移可以在人类体细胞的基因组中找到,尤其是在癌症基因组,”邓宁说朱莉·c·Hotopp,博士,微生物学和免疫学副教授基因组科学研究所(IGS)马里兰大学医学院和该论文的第一作者。Hotopp博士也研究科学家和马里兰大学的玛琳斯图尔特Greenebaum癌症中心。“研究将此方法应用于其他癌症基因组项目可能是富有成效的,导致我们更好的理解癌症的机制。”

在研究、跨学科的一组科学家和生物信息学研究人员发现,只有63.5%的TCGA样本分析来自肿瘤,肿瘤样本中含有99.9%的读取支持细菌集成。LGT的数据提出一个令人信服的案例发生在人类体细胞基因组,它有一个重要的角色在人类癌症和其他疾病与基因突变有关。LGT突变可能发生过程中发挥作用,但也有可能,他们可能只是旅客突变。

研究人员建议几个相互竞争的观点解释结果,但还需要更多的研究来确定的答案。一种可能性是,突变是致癌作用的一部分,正常细胞转变为癌细胞的过程。另外,肿瘤细胞迅速增殖,他们可能更宽容的横向基因转移。也有可能这些细菌引起这些突变,因为他们的细菌中获益。

这项研究是由美国国立卫生研究院的主任的新创新者奖项目(1-DP2-OD007372)和NSF微生物测序项目(ef - 0826732)。

“这是基础科学研究的类型,进行了使用公开可用的基因组数据的分析,使我们领导人在基因组科学和个性化医学的前沿领域,“e . Albert Reece说,医学博士博士、mba医学事务副总裁马里兰大学和约翰·z和作者k·鲍尔斯特聘教授和马里兰大学医学院的院长。“这只是这种类型的研究,将会引领我们到一个新的个性化医疗的世界,医生可以使用每个病人的基因组组成来确定护理和预防措施。我们兴奋的一部分未来基因组科学研究所的出色的工作。”