在人口艾滋病毒耐药性的进化

耐药突变艾滋病毒的遗传多样性减少其他病毒基因组内传播时被感染的病人,但他们这样做在不同的患者在不同的程度上。一项新的研究发表在公共科学图书馆遗传学博士,Pleuni彭宁斯j .和他的同事们发现,在某些特定药物患者耐药突变出现在一个单一的病毒粒子,然后迅速扩散到整个病毒种群内的病人由后代,也是耐药性。在其他病人相同的电阻突变发生在多个病毒颗粒在一个短的时间窗口,导致更多的异构,但还是耐药,病毒数量。

有关的一个大问题,现在生物学家研究艾滋病的二十年是“有效的人口规模”的病毒在一个病人。有效的人口规模是一个数学量决定,除此之外,耐药性可能会发展的速度有多快。这个量的估计艾滋病毒基于不同的方法范围广泛,从1000年到100000000年,让研究人员感到困惑。彭宁斯j .博士和他的同事们发现艾滋病毒的耐药性的发展通过所谓软硬选择性清洁工。耐在硬性扫中,整个人口由后代一个病毒粒子;在软扫描,它由不同的病毒粒子的后代。这两种扫描离开不同的病毒基因组的签名:清洁工清除遗传多样性,而软清洁工不。彭宁斯j .和他的同事们意识到,他们可以利用软、硬清洁工为特定的分数耐药性突变称为K103N估计艾滋病毒在患者的有效种群大小。他们估计这个量是150000左右。

在目前的研究中,彭宁斯j .博士和他的同事们进行重新分析一个老数据集从一个临床试验在1990年代末。数据非常丰富,与多个序列在多个时间点超过一百名患者。作者关注病人的一个子集,电阻的进化可能是最好的观察。在这个子集的患者,目前的研究令人信服地表明,软扫荡,并硬清洁工发生在艾滋病毒。

在未来,彭宁斯j .博士研究计划病人这些药物与其他药物治疗,了解影响艾滋病病毒有效人口规模。这项研究可能有助于理解哪些药物更有效预防耐药性的进化。