药物数据库允许研究人员匹配旧药物的新用途

有成千上万的药物,成千上万的致癌基因异常沉默。有些药物在使用了,但是很多可以用这些药物被坐在书架或超出他们最初批准的疾病。再利用这些药物取决于匹配药物目标。最近的一项研究发表在杂志上生物信息学描述了一种新的数据库和模式匹配算法,允许研究人员评估合理的药物和药物组合,并推荐一种新的药物组合治疗耐药非小细胞肺癌。

“大多数癌症有多个基因交替。甚至基因靶向药物倾向于只影响超过他们的既定目标。所以挑战是匹配的与许多影响与癌症的药物,很多原因,最好的地图药物影响到目标,”Choon Aik队效力谭博士说,调查员在科罗拉多大学癌症中心和生物信息学副教授铜医学院。

大约有500个激酶在人类基因组中,每一个都代表一个潜在的重要目标。谭描述了数据库表格500列,每一列代表一个激酶。将每一行是一种药物,然后在每一列细胞,药物对激酶的活性。

“想象你知道癌症是由五个激酶一致行动,”Tan说。“我们的方法将允许您查询的数据库模式和发现药物或药物组合的最佳匹配的基因需要。”

因为很多这些药物已经获得FDA批准用于其他疾病,重新定位这些药物的过程参与和昂贵的新疾病远低于如果药物开发人员已经开始新鲜。

谭和他的同事们把技术使用推荐的药物可以关掉非小细胞肺癌的激酶用于创建抵抗现有的治疗方法。这是一个重要的问题——许多肺癌取决于over-activation表皮生长因子受体的基因,但当使用抗表皮生长因子受体抑制剂吉非替尼和埃罗替尼,癌症会激活其他“激酶”允许癌症旁路这种依赖。谭和他的同事们要求这些激酶,使肺逃避吉非替尼,和其他药物可能会关闭它们。

答案可能是药物bosutinib,由辉瑞公司开发,2013年获得FDA批准用于治疗慢性粒细胞白血病。药物胜过了身体的能量来源,ATP,空间在激酶被激活。事实证明,bosutinib可以抑制完全的活动EGFR-dependent肺癌需要变异周围表皮生长因子受体抑制剂的挑战。

在测试EGFR-dependent细胞系,谭和他的同事们表明,药物吉非替尼和bosutinib“显示添加剂和协同效应”。

在谭有望成为常见的一种机制,他的小组现在将手从这个理性的组合其他铜癌症中心和其他地方的研究人员将这些药物对人类的临床试验。

更多信息:K-Map数据库在tanlab.ucdenver.edu/kMap/在线,免费使用

期刊信息: 生物信息学

引用:药物数据库允许研究人员匹配旧药物新用途(2014年5月22日)2023年2月22日从//www.pyrotek-europe.com/news/2014-05-drug-target-database-drugs.html检索
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