研究人员开发了一种新方法来确定癌症的“驱动因素”
北卡罗来纳大学莱恩伯格综合癌症中心的研究人员开发了一种新的综合方法来精确定位癌症的遗传“驱动因素”,发现了8个可能用于靶向乳腺癌治疗的基因。
这项研究于8月24日在网上发表自然遗传学,由第一作者、博士后研究助理Michael Gatza博士撰写;Grace Silva,研究生;Joel Parker,博士,北卡罗来纳大学莱因伯格分校生物信息学主任;程帆,副研究员;资深作者查克·佩鲁博士,遗传学和病理学教授。
这些研究人员研究了多种致癌途径,即正常细胞转变为癌细胞的逐步遗传改变,包括控制癌症的途径癌细胞生长利率。一种生长速度高的细胞,又称细胞增殖,被认为与预后不良有关乳腺癌病人。
通过分析多种类型的基因组数据,北卡罗来纳大学莱因伯格分校的研究人员能够识别出在基因组DNA水平上扩增的8个基因,这些基因对于腔内乳腺癌(最常见的乳腺癌亚型)的细胞增殖是必要的。
“使用这种新的计算方法,我们能够利用现有的丰富数据资源,为乳腺癌患者的特定子集确定一些新的潜在药物靶点。这是迈向更个性化医疗的重要一步,”Perou说。
事实上,其中一个被鉴定的基因——CPT1A——已经是淋巴瘤药物开发的一个靶点,并有可能进行测试乳腺癌患者也靶向CPT1A的药物已被证明在体外和小鼠淋巴瘤模型中抑制人类癌细胞系的生长。
这种用于更好地了解癌症驱动因素的分析方法包括对多种数据类型的综合和集成分析,包括基因表达数据、体细胞突变、DNA拷贝数和功能基因组学数据集。
虽然这项研究的重点是确定乳腺癌的遗传驱动因素,但这种方法也可以很容易地应用于其他类型的肿瘤。该研究的主要作者Mike Gatza补充说:“虽然我们能够确定乳腺癌的驱动因素,但这种方法将来可以也将应用于其他类型的肿瘤。”
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