Whole-exome测序显示潜在的诊断工具

在一组2000例患者转诊疑似遗传评估条件,whole-exome测序提供了一个潜在的分子诊断为25%,包括一些罕见的基因事件检测和新的突变导致疾病,据研究中出现《美国医学会杂志》。这项研究发布恰逢美国人类遗传学协会年会。

Whole-exome测序分析成千上万的基因的外显子或编码区域同时使用新一代测序技术。的外显子组测序一个病人和比较它与正常的参考序列,个体的DNA序列的变化可以被识别和相关回到个人的医疗问题,以发现医疗疾病的遗传原因,根据这篇文章的背景信息。

杨yap博士,医学博士克里斯汀·m·英格休斯顿贝勒医学院的,和他的同事,之前对whole-exome测序进行了初步研究,包括250名患者。当前的研究包括2000名患者(主要是儿童,88%),临床whole-exome测序分析2012年6月至2014年8月。测试是由病人的医生怀疑遗传疾病。外周血、组织或提取DNA样本收集病人或他们的父母。大多数患者神经紊乱或发育迟缓(87.8%;神经系统、神经+其他器官系统和特定的神经组)和12.2%的患者神经障碍(神经科学组)。

一个分子诊断据报道504名患者(25.2%)与58%的诊断不突变之前报道。分子诊断的利率为每个表型(物理表现)类别是143/526(27.2%)的神经组织,282/1,147(24.6%)的神经+其他器官系统集团,30/83(36.1%)为特定的神经组织,和49/244(20.1%)的神经组织。

95年2000例,医学上可操作的偶然发现报道在92名患者(4.6%)。三个病人有超过1这样的发现。59例(3%),偶然发现发生在基因包括在美国大学医学遗传学和基因组学的56个基因列表建议披露。剩余的33例(1.7%)基因突变的报道基于研究者的报告当地标准医学上可操作的结果。

“分子诊断25%的速度是我们初步研究中观察到的250例和保持一致的这个大系列主要儿科患者不同临床表现最明显的智力障碍和神经系统表型,”作者写道。

他们补充说,大约30%的阳性病例报告在此假定存在诱发突变致病基因发现自2011年以来,反映了一个加速疾病基因发现的好处。“Whole-exome测序检测是一个平台适合及时将新的疾病基因因为它质问整个编码区域,从而能够自动更新临床报告疾病基因的注释,即使完成初步分析。”

研究人员得出结论,“观察whole-exome测序可能提供的灵活性和产量优势传统的分子诊断方法在某些病人。”