癌症研究人员打开“潘多拉的盒子”的潜在生物标志物

一项新的分析打开门发现成千上万的潜在的新癌症生物标记。

密歇根大学综合癌症中心的研究人员分析了全球格局的部分基因组以前没有好好研究过长非编码rna。这绝大部分人类基因组被认为是暗物质,因为所知甚少。出现新的证据表明lncRNAs可能发挥作用在癌症和更好的理解他们可能导致新的潜在的改善目标癌症诊断、预后或治疗。

“我们知道蛋白质编码基因,但这只代表1 - 2基因组的百分比。不太了解生物学的非编码基因组而言,如何在人类疾病如癌症,”高级研究作者Arul m . Chinnaiyan说,医学博士,Ph.D., director of the Michigan Center for Translational Pathology and S.P. Hicks Professor of Pathology at the University of Michigan Medical School.

研究人员齐心协力25独立数据集共7256 RNA序列样本。数据来自癌症基因组图谱等公共资源项目,以及临床病理中心的档案。他们应用高通量核糖核酸测序技术来识别超过58000 lncRNA基因在正常组织和一系列常见的癌症类型。

研究结果出现在网上自然遗传学。

“我们用所有这些数据解读基因组景观是什么样子在不同的组织以及癌症,”Chinnaiyan说。“这打开了一个潘多拉的盒子lncRNAs调查的各种生物标志物的潜力。”

完整的数据集,名叫MiTranscriptome纲要,一直在提供一个公共网站,http://www.mitranscriptome.org科学界探索。

研究者还发现了一个lncRNA, SChLAP1侵略性前列腺癌的潜在生物标志物。SChLAP1更高度表达转移性前列腺癌比在早期阶段疾病。SChLAP1主要在被发现前列腺癌细胞,而不是在其他癌症或正常细胞,这给研究人员希望可以开发一种非侵入性的测试来检测SChLAP1。这种测试可以用来帮助病人和他们的医生让早期的治疗决定前列腺癌。

“一些长非编码rna往往是精美具体癌症,而蛋白质编码基因往往不是这样。这就是让lncRNAs的非常有前途的目标发展生物标记,”Chinnaiyan说。“我们希望研究人员将调查MiTransciptome纲要并开始提名lncRNAs进一步研究和发展。很可能只有一个子集的拥有真正的函数,而是作为一个以前未开发的区域,它拥有更大的潜力。”