绘制肠道微生物组图,以更好地了解其在肥胖中的作用
最近的几项科学研究声称,肠道微生物群——生活在胃和肠道中的各种细菌——可能是肥胖的罪魁祸首。但格莱斯顿研究所的高级研究员凯瑟琳·波拉德博士说,事情没有那么简单。
波拉德博士于2015年2月13日星期五在加州圣何塞举行的美国科学促进会年会上的肥胖与微生物组研讨会上发表了讲话。
波拉德博士和她的团队使用强大的计算工具重新分析了之前的几项研究,发现两者之间没有显著的关系身体质量指数(BMI)和肠道微生物类型的关系。事实上,她的实验室发现有更大的可变性肠道细菌不同的研究之间比精益和肥胖的人在每个研究中。
相反,波拉德博士认为,最重要的是不同菌株的基因组成。这是因为细菌中的DNA差异很大。例如,虽然两个人的基因组可能只有0.1%的差异,但同一种细菌的两种菌株可能会有30%的差异——类似于人类和小鼠基因组之间的差异!更重要的是,细菌基因组的差异通常是参与代谢或糖和脂肪加工的重要片段。
除了反映细菌基因组的重要功能变化外,基因的损失和获得也会影响基因组大小.当使用宏基因组学研究微生物组时——测序它们的总dna——细菌的差异基因组大小会使样本中每个基因比例的估计产生偏差。通过开发一种计算捷径,利用统计建模快速估计基因组大小,波拉德博士的团队已经能够提高微生物组研究的准确性。
波拉德博士解释说:“仅仅说出细菌种类是不够的,因为这并不能告诉你它们在做什么。”“由于同一物种的两种菌株可能具有如此不同的基因组,所以你真的需要知道那里有哪些基因,以及它们在将某人的肠道微生物群与BMI或疾病联系起来方面发挥着什么作用。”