新策略映射管理网络与多基因疾病相关

马萨诸塞大学医学院的科学家们有一个强大的工具以一种新的方式应用于特征与人类疾病相关的遗传变异。工作,今天发表在细胞,将使科学家们更容易有效地描述潜在基因变化复杂,多基因疾病。

“到目前为止,我们只能够调查一个致病突变,”首席研究员玛丽安Walhout说,博士项目联合系统生物学和分子医学教授各处。“我们现在有一个健壮的平台,让我们能够询问数百突变在一个实验。这将帮助我们开发的地图的交互的网络控制基因表达并确定如何在基因组突变产生多种人类疾病。”

爆炸在全基因组的研究中,通常被称为全基因组关联研究或GWAS,带来了巨大的改善基因测序技术帮助科学家找到成千上万的基因变异与数百种不同的疾病相关。然而,多达90%的基因组中发现这些突变区域不编码蛋白质,Walhout博士说。

转录因子或他们的DNA结合位点的突变可以导致疾病通过扰乱基因调控。这导致太多,或者不够,目标蛋白质。各种各样的疾病,包括癌症、神经系统疾病、血液疾病和代谢疾病与异常的基因调控。

“这些GWAS的大多数疾病有关的突变已经确定不改变蛋白质本身,但位于监管区域和可能,因此,改变蛋白质的水平,”胡安Fuxman巴斯说,博士,博士后研究员的主要作者细胞研究。“我们面临的挑战一直是确定如何以及为什么这些突变导致疾病。”

使用增强,gene-centered酵母一个杂化(eY1H)化验Walhout集团于2011年开发人员能够执行成千上万的实验涉及1000个转录因子和超过100个基因变异。结果,他们能够检测得失两个网站和DNA之间的相互作用转录因子与基因表达的变化是一致的,被发现在相关的疾病。

“这个系统提供了一个工具深入审讯的角色遗传变异和不同的转录因子的相互作用在扰乱基因调控网络”,Walhout总结道。“这是一个蓝图理解这些网络和连接是如何影响疾病。”