Allen Cell类型数据库启动

艾伦脑科学研究所今天宣布，随着艾伦细胞类型数据库的启动，他们迈出了为大脑创建可搜索标准数据库的第一个重大科学步骤。第一次发布的信息包括240多个神经元的位置、电活动和形状。

“在…方面取得进展大脑艾伦研究所首席执行官艾伦·琼斯博士说:“在研究中，我们需要建立标准，让全世界的神经科学家共享。”“这些细胞类型最终可能在神经科学中发挥与化学元素周期表相同的作用。”

这个可公开访问的数据库代表了艾伦研究所十年计划的第一个成果，该计划旨在了解大脑活动如何导致感知、决策和行动。了解细胞类型——大脑的组成部分——对于理解健康的大脑如何运作以及自闭症、阿尔茨海默病和帕金森病等疾病的问题是至关重要的。

艾伦脑科学研究所总裁兼首席科学官克里斯托弗·科赫博士说:“识别神经元细胞类型对于解开大脑如何处理信息并产生感知、记忆和意识的奥秘至关重要。”“这是第一个将多种类型的数据汇集在一起的资源——形状、大脑中的位置和脑电活动——在地球上任何地方的一个可搜索数据库中。”

艾伦细胞类型数据库包含小鼠视觉皮层单个神经元的详细信息。在用光学显微镜以高分辨率捕捉到它们的形状之前，它们的细胞体受到刺激时的电活动被微型电极记录下来。该版本还将提供部分细胞的数字重建形态，以及忠实模拟这些细胞电学行为的不同类型的计算机模型。

该版本包括Allen软件开发工具包(SDK):一个包含细胞神经元模型的配套源代码存储库。这个工具允许科学家下载模型并进行他们自己的虚拟实验。

数据库中的每个单元都有一个相关的模型电活动艾伦脑科学研究所(Allen Institute for Brain Science)的首席技术官秦当(Chinh Dang)说。“这些模型让感兴趣的科学家不仅能观察到单个细胞而是进行定量和分析比较，最终将有助于区分细胞类型。”

关于该产品未来发布的数据将包括来自人类皮层的细胞和关于单个细胞中基因表达的信息。

数据发布的另一个组成部分是艾伦研究所最新的科学小插图:一个动态动画，指导用户进行分类细胞类型通过分析在单个神经元中表达的数千个基因动画中大约1600个细胞的基因表达数据也将被公开。这两种资源都展示了可以通过结合形态学、电学和转录分析来收集的未来见解。

琼斯说:“通过现在向公众提供这样的数据库，我们正在构建一个基本框架，使我们能够使用相同的语言，并帮助更大的社区回答神经科学领域未来的问题。”