肿瘤基因组测序研究进展的潜力和基于dna的血液测试精确治疗
基因测序研究101例胰腺癌和血液的约翰霍普金斯Kimmel癌症中心的科学家们说他们发现至少有三分之一的病人的肿瘤基因突变,可能有一天帮助指导精密治疗他们的疾病。血液测试的结果从肿瘤检测DNA棚,他们说,还预测癌症复发去年同期的一半以上,而不是标准的成像方法。
”胰腺癌死亡率最高的癌症之一。许多人认为没有治疗方法,但是我们的研究表明,基因组测序病人的肿瘤样本的识别突变匹配某些临床试验或药物的目标更精确地适合这些病人,”医学博士Victor Velculescu说博士,肿瘤学和病理学教授约翰·霍普金斯大学医学院的主任和Kimmel癌症中心的癌症生物学计划。
Velculescu警告说,对病人实现treatment-guiding基因组测序,研究人员首先将需要开发更大,多试验使用实验或批准的药物目标约翰斯霍普金斯先于团队发现的突变。目前,胰腺癌治疗手术,放疗和化疗。
测序的研究结果,利用个人基因组数据生成的诊断公司,公司由约翰霍普金斯大学的研究人员共同创立,发表在7月7日的问题自然通讯。
胰腺癌诊断在美国每年将近50000人。少于10%的人生存5年多过去诊断,和大多数病人处方疗法是基于他们的疾病阶段,不是癌症的基因特性。
测序研究,Velculescu和他的同事们收集了101名患者的肿瘤样本和正常的DNA与II期胰腺癌的肿瘤手术切除在宾夕法尼亚大学,哥本哈根大学和华盛顿大学圣路易斯。
团队测序整个外,或编码区域的基因组,24 101名患者的肿瘤和正常的DNA基因驱动癌症的增长,当中唯一的常见变异。之后,该集团在肿瘤和正常DNA测序的其他病人,专门寻找突变促进基因的一个子集。
胰腺癌组织通常很难序列,突变是具有挑战性的,博士合著者马克Sausen说Velculescu前研究生的实验室研究完工时现受雇于个人基因组诊断公司,为了克服这个团队使用敏感的“深度测序”方法,分析每个核苷酸基地750倍来确定突变基因。
团队报告说,98年的101名患者在已知的胰腺癌肿瘤突变基因,TP53,喀斯特。Sausen说,到目前为止,药物目标这两个突变有令人失望的结果。然而,研究发现患者38突变基因ERBB2等PI3KCA, BRCA2, AKT1和AKT2的焦点已经批准的其他疾病的药物,或正在进行的或发表的临床试验。
Velculescu由约翰霍普金斯科学家说以前公布的研究提供的证据原则恰恰药物疗法的潜在价值选择的能力解决特定癌症突变。他们测序与胰腺癌的肿瘤病人,发现PALB2基因的突变,这是参与修复DNA损伤。当医生治疗病人与丝裂霉素C,能损伤dna的药物,病人存活5年多过去诊断,远远超出平均生存的估计。
突变基因中发现新测序研究染色质有关的规定,这一过程指导如何DNA打开小的部分本身,使酶激活基因。20名患者(20%)在当前测序研究在ARID1A或MLL chromatin-regulating突变基因和治疗与常规治疗患者的总体生存缺乏突变的两倍。十一突变患者MLL基因32个月后还活着,为15个月患者正常MLL基因。
在进一步的实验中,科学家们收集血液样本每三个月从早期胰腺癌患者51 101受试者cancer-44测序在当前的研究中额外加7患者三年。51的一些22(43%)血液中检测到水平的癌症DNA的时候他们的诊断。此外,科学家们预测病人的癌症复发手术后六个月前通过寻找癌症DNA脱落进入血液,而标准的成像。
“我们发现复发越早,越早我们可以用额外的治疗干预,“Velculescu说。“研究液体活检用血液样本是不断发展的,但这些初步结果提供希望发展中残余疾病的早期检测和实时监控的方法病人癌症。”
他说,大临床试验还需要确定临床blood-based DNA测试的有效性。
测序分析肿瘤组织和基于dna的血液测试成本数千美元,Velculescu说,由商业公司和某些医院提供。
如果额外的研究发现测序对指导治疗有效,他设想的DNA测序目标地区肿瘤组织或血液测试。他说,他的团队已经缩小了的基因可能有助于指导治疗,尽管会有一些额外的基因错过了在当前的研究中。
