新一代基因组测试ID食脑一族变形虫

去年夏天,一个74岁的旧金山的唐人街的居民被旧金山综合医院和发烧和定向障碍、创伤中心,迅速演变成一场昏迷。

她尖叫,她患有脑炎症状,脑部感染,但一系列测试和肺结核药物,细菌和真菌感染,甚至toxoplasmosis-could确定感染的原因和做任何事情让她复活。

她死于16天后,她的病对她的临床医生仍然是个谜。

遗憾的是,这一结果的大脑太常见的感染病例,这在加州不了了之的6倍,据2006年旧金山加州大学的一项研究。

生化学家Joe DeRisi博士和神经学家迈克尔·威尔逊,医学博士统计,加州大学旧金山分校的想改变,他们认为他们有工具。

当研究人员得知去年夏天的神秘脑炎,他们转向尖端基因组工具来跟踪女人的疾病的原因。

他们使用快速下一代基因测序搜索病人的脊髓液为非人类的DNA,然后比较他们发现针对数据库的每个已知的入侵微生物或病毒的基因。这种“宏基因组”的方法迅速找到了一个匹配:一种常见的土壤中变形虫叫Balamuthia mandrillaris,研究人员在《华尔街日报》上月报道神经病学年鉴。

研究者和他们的同事们最近成立了一个新的下一代精密医学诊断中心帮助医院让脑炎的根源genome-based屏幕标准治疗的一部分。

技术可以省钱以及生活。去年夏天在她两周的住院治疗,照顾Balamuthia受害者的成本超过100000美元。宏基因组屏幕,相比之下成本仅为2000美元,一般需要两天。

中心的首要任务之一将是一项研究以确定当在脑炎病人的护理技术将具有最大的临床影响。研究人员将梳理脑炎病例的数据库来识别便宜时,现有的100美元的抽血等治疗有效地诊断病人的疾病和对临床医师的时候转向中心的大基因枪。

“我们都同意这些宏基因组屏幕上发生的太迟了,”加州大学伯克利分校的卫生经济学家布伦特富尔顿说,博士、MBA,部分中心的团队领导这项研究。“UCSF被调用的时候,医生已经试过一切都在阳光下,这是一个糟糕的情况。”

但是早期的测试应该怎么做呢?它仍然是一个悬而未决的问题,根据富尔顿。“2000美元的测试,不容忽视,如果原来没有改变的常规护理,”他解释道。“但平衡一个多周,50美元住院,没什么事。”

通过新的中心,DeRisi希望做出这样神秘的大脑感染筛查医院首选测试而不是最后一个。目前dpctors通常需要直接追踪DeRisi和他的同行们请求帮助,他说。“我们需要使这成为一个实际的临床诊断,所以医生不知道我的电话号码就可以订购这个测试。”