研究人员使用肠道细菌合成基因分类结直肠肿瘤

通过分析肠道细菌的类型呈现在结直肠肿瘤,研究人员已经找到一种方法来预测肿瘤的关键基因突变,这种方法可能最终通知结直肠癌诊断和治疗的发展。他们的研究结果发表在美国人类遗传学(ASHG)协会2015年会在巴尔的摩。

由跑Blekhman博士,助理教授遗传学,细胞生物学,明尼苏达大学的发展和该研究的资深作者,研究人员检测了大肠癌之间的遗传差异肿瘤从44成人细胞和结肠健康的细胞结肠直肠癌。他们寻找特定的突变之间的相关性在肿瘤细胞和肿瘤的复合微生物,细菌的类型存在于肿瘤的直接环境和他们的相对丰度,发现两者之间的关系。

“我们是第一个研究来分析这两个因素结合在一起,”迈克尔·b·伯恩斯说,博士,博士后研究员Blekhman博士的实验室。“先前的研究已经发现某些突变和结直肠之间的关联癌症某些微生物特性和癌症之间,但没有集成两个,”他解释道。

研究人员发现,一般来说,癌症相关的基因突变一个人的肿瘤细胞,更多样的微生物是他或她的肿瘤。事实上,特定的肿瘤细胞突变与特定类型的细菌微生物的存在。和丹一起骑士,博士,助理教授计算机科学和生物技术明尼苏达大学,Blekhman博士和他的同事们开发了一种方法来预测突变出现在肿瘤的类型根据其微生物。平均而言,该方法正确预测大约一半的肿瘤中最常见的突变。

“我们发现,它可能基因分类结直肠肿瘤一个人不用做活检,解剖它,“Blekhman博士说。“这最终可能会提供一个非侵入性和廉价的方法来告知诊断和治疗。”

从长远来看,他补充说,这项研究也可以通知开发新的治疗结直肠癌。”通过研究肿瘤和细菌的微生物之间的相互作用,我们将更好地了解细菌的作用,导致肿瘤形成和成长——如果他们甚至有这样的一个角色——最终,我们也许能够治疗癌症的微生物通过改变方面,“Blekhman博士说。

研究人员警告说,他们目前的研究结果显示只有一个相关性微生物组成和突变结直肠肿瘤。到目前为止,没有证据表明细菌的变化导致结肠直肠癌,但Blekhman博士和他的同事计划实验来研究这个问题。他们还计划评估结直肠肿瘤是否微生物成分可以从粪便样本化验,如果这些数据也可以用来预测的类型突变出现在肿瘤细胞。

---

---