一种鼠疫细菌引发了历史上和现代的多次大流行
鼠疫细菌进入欧洲的一次入侵导致了14世纪中期的黑死病。在随后的四个世纪里，同样的菌株在欧洲大陆反复爆发，直到19世纪晚期传播到中国，引发了第三次鼠疫大流行。后来传播到亚洲的鼠疫浪潮成为现代全球流行病的源头人口。2016年6月8日发表的基因组分析揭示了这种细菌随时间变化的路径细胞宿主和微生物．
“我们的研究是第一个提供基因支持的瘟疫该研究报告的第一作者、马克斯·普朗克人类历史科学研究所的玛丽亚·斯派鲁说:“黑死病是在黑死病之后从欧洲传播到亚洲的，它在14世纪中期的黑死病和现代鼠疫之间建立了联系。”
鼠疫细菌,鼠疫杆菌是人类历史上最致命的病原体之一，引发了三次大流行病:查士丁尼瘟疫(鼠疫of Justinian)，在6世纪和8世纪期间袭击了罗马帝国;第二次瘟疫大流行，于14世纪中期黑死病首次在欧洲爆发，并在18世纪中期之前持续不断地侵袭欧洲大陆;以及第三次鼠疫大流行，发生在19世纪末的中国。
基于古代DNA样本和历史气候模式的证据表明，第二次大流行的反复爆发是由病毒的多次重新传入引起的鼠疫杆菌很可能是从亚洲进入欧洲此外，一些科学家最近提出鼠疫细菌黑死病之后从欧洲迁徙到亚洲，后来又引发了第三次大流行。但直到现在，支持这一模型的基因组证据仍然缺失。
为了阐明第二次大流行的起源和路径，Spyrou和马克斯普朗克人类历史科学研究所的Alexander Herbig、Kirsten Bos和Johannes Krause从埋葬在西班牙巴塞罗那和德国埃尔旺根的万人坑以及俄罗斯Bolgar市的一个坟墓中的鼠疫感染者中收集了样本。
赫比格说:“我们的样本来自大规模埋葬，通常代表着在一次鼠疫爆发期间，数百人死于鼠疫的事件。”“这让我们对这种疾病在中世纪的影响有了一个印象。”
博尔加尔城遗址可以追溯到14世纪下半叶，使用的是已知的1362年后铸造的钱币工艺品。来自骨头碎片和牙根的放射性碳年代估计巴塞罗那在1300-1420年，博尔加市在1298-1388年，埃尔旺根在1486-1627年。
在分析了178个人牙齿的DNA提取后，研究人员发现鼠疫耶尔森氏菌属提取了32个人的DNA。来自巴塞罗那、博尔加市和埃尔旺根的三个人有足够的钱鼠疫耶尔森氏菌属用于基因组水平分析的DNA。研究人员对这三位古人的基因组进行了测序鼠疫耶尔森氏菌属菌株，并将其与148个先前测序的古代和现代菌株进行比较，以重建鼠疫菌的系统发育树。
系统发育分析显示，来自巴塞罗那的黑死病菌株与此前来自14世纪中期伦敦的基因分型菌株之间没有差异。在南欧和北欧同时出现的同一株病毒表明了这一点鼠疫耶尔森氏菌属在黑死病期间，是单波而不是多次脉冲进入欧洲大陆的。
这些来自伦敦和巴塞罗那的黑死病毒株衍生出一个包含埃尔旺根毒株的分支，此前还对来自法国马赛大瘟疫的18世纪毒株进行了测序。此外，所有三个新重建的基因组和之前从第二次鼠疫中测序的基因组在系统发育树的同一个分支中组合在一起。综合来看，这些发现表明一个单一的鼠疫耶尔森氏菌属他的血统导致了黑死病以及随后在欧洲爆发的第二次大流行。
同时，Bolgar City菌株与伦敦黑死病菌株以及所有现代菌株有相似之处。这一发现支持了这一观点鼠疫耶尔森氏菌属血统在黑死病后从欧洲传到了亚洲，后来引发了第三次大流行和现代全球流行病。
克劳斯说:“我们最重要的发现揭示了黑死病和现代鼠疫之间的联系。”“尽管今天在中国存在着几种鼠疫谱系，但只有几个世纪前导致黑死病的谱系在19世纪末的大流行中离开了东南亚，并迅速在全球范围内传播。”
在未来的研究中，研究人员计划进一步了解黑死病在欧洲的起始点和终点。他们希望扩大样本范围，进一步探索这些区域，以更好地了解这种疾病的传播途径，它在不同阶段获得的进化变化，以及它对人类造成的损失。
Bos说:“我们希望我们的发现将突出对世界各地古代和现代鼠疫分离株进行更广泛采样和测序的重要性，并就欧洲和西亚在鼠疫进化和生态学中所起的作用开辟新的研究主题。”
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