“神秘的”非蛋白质编码rna在基因表达中发挥着重要作用
在细胞中,DNA被转录成rna,为细胞制造蛋白质提供分子配方。大部分基因组被转录成RNA,但只有一小部分RNA实际上来自基因组的蛋白质编码区。
“为什么非编码区域会被转录?”它们的功能一直很神秘,”宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院宾夕法尼亚表观遗传学研究所主任、细胞与发育生物学教授Shelley Berger博士说。
伯杰和她实验室的博士后丹尼尔·博斯博士研究基因表达从增强剂的非编码区域基因组离蛋白质编码区更远。增强子提高了附近蛋白质编码基因的基因表达速率,这样细胞就能泵出更多所需的蛋白质分子。一种被称为增强子rna (eRNAs)的神秘非编码rna子集是从增强子序列转录而来的。虽然这些对促进基因表达很重要,但它们是如何实现这一点的还完全未知。
他们对这些难以捉摸的eRNAs有了新的认识,他们表明CBP(一种激活增强子转录的酶)直接与eRNAs结合。这个简单的行为通过调节乙酰化来控制生物中基因表达的模式,乙酰化是一种化学标记,可以引导紧紧包裹在细胞核中的DNA松弛以促进转录。他们的研究结果发表在本周的细胞.
Bose说:“我们体内的细胞拥有相同的基因和DNA序列,唯一不同的是这些基因的表达方式。”“增强子和erna对这一过程至关重要。我们的工作展示了一种令人兴奋的erna产生这些不同基因表达模式的新方式。我们询问了erna是否直接与CBP合作,并发现确实如此。”
通过生化分析,他们发现CBP与RNA结合的区域也可以调节CBP与化学标记一起工作的能力。通过与该区域结合,eRNAs可以直接刺激CBPs的乙酰化活性。
Berger说:“癌症生物学领域对增强子和erna的兴趣越来越大,因为有缺陷的增强子可以导致蛋白质的生成过多或过少,或者导致编码区域关闭或打开,或者可以在错误的时间制造蛋白质。”了解更多增强子和erna的功能将有助于肿瘤学家,因为最近对人类肿瘤的DNA测序显示,与癌症和其他疾病相关的大量突变发生在基因组的增强子区域,而不是蛋白质编码区域。
伯杰说:“从根本上说,这是一门重要的科学,因为我们表明增强子rna在整个基因组和身体中都起着指导蛋白质生产的关键作用。”“我们发现,在整个基因组中,增强子RNA是与CBP结合的最常见的RNA类型,通过这种相互作用,eRNAs在调节CBP活性和基因表达方面发挥着至关重要的作用。”