研究人员发现了宫颈癌的新亚型

南卡罗来纳大学的研究人员发现了一种新的宫颈癌亚型
人宫颈癌中人乳头瘤病毒(HPV)转录图谱。每个线段描述了一个唯一的测序读数,其和表示每个基因的表达水平。HPV活性宫颈癌的特征是HPV E6和E7癌基因的强表达,这可以从排列测序reads的数量上看出。图源:Carolyn Banister/南卡罗来纳大学

由Carolyn Banister和Phillip Buckhaults领导的南卡罗来纳大学科学家团队发现了一种新的子宫颈癌亚型,与大多数子宫颈癌一样,由人乳头瘤病毒(HPV)引发,但其生长不受病毒控制,这表明针对这些肿瘤独特的基因组途径的治疗可能比标准治疗更能改善患者的结果。

“颈目前治疗作为一个统一的组基于化疗和放疗方案,帮助最大比例的人;然而,其中三分之一的患者并没有得到标准治疗的帮助。”“我们发现存在一种基因特征非常不同的子宫颈癌亚群。这些妇女可能受益于通常不给予的替代治疗病人。”

来自南卡罗来纳大学药学院和医学院的研究人员通过分析来自癌症基因组图谱(国家癌症研究所和国家人类基因组研究所于2005年发起的大规模联邦资助项目)中的255个宫颈癌样本的数据发现,两种被认为是宫颈癌生长所必需的HPV致癌基因在宫颈癌中要么以高水平(HPV活性类)表达,要么以低水平或零水平(HPV非活性类)表达癌症。这项研究于1月6日发表在该杂志的网络版上Oncotarget

南卡罗莱纳大学的Lucia piris - kim Creek研究小组先前的研究报告了在头颈部癌症中存在HPV非活性类,并提出了HPV非活性宫颈癌可能起源于病毒驱动的癌症,随后独立于HPV起作用的可能性。这项工作证实了这些怀疑,并发现了驱动hpv非活性癌症进化的新的分子遗传机制。

除了HPV癌基因表达外,研究人员还注意到HPV非活跃和活跃亚型宫颈癌之间的其他明显差异。他们发现在中位诊断年龄(54岁vs. 45岁,p = 0.02)、中位生存期(715天vs. 3046天,p = 0.0003)、DNA甲基化和基因表达谱以及肿瘤细胞类型分布方面存在显著差异,腺癌在hpv无活性肿瘤中比在hpv活性肿瘤中更常见(p = 0.00022)。

研究人员还分析了所有人类基因的体细胞突变频率。他们发现19个癌症驱动基因在hpv非活跃类中突变率明显高于hpv活跃类。这些差异表明这些突变基因取代了通常由HPV癌基因提供的调节肿瘤细胞生长的功能。

例如,HPV不活跃的肿瘤含有破坏性TP53基因突变的可能性比HPV活跃的宫颈癌高17倍,这使得不必要表达HPV E6癌基因。作者认为,针对TP53突变的治疗可能会为hpv非活性肿瘤患者带来更好的临床结果。

Banister说:“治疗宫颈癌患者的医生应该检测这些肿瘤中HPV癌基因的表达,并考虑根据HPV活性进行个性化治疗。”hpv活性肿瘤具有高表达的免疫调节基因,因此可能对免疫检查点抑制剂治疗有反应。相反,hpv非活性肿瘤通常在PIK3CA/PTEN/AKT通路中有突变,这表明AKT激酶抑制剂可能是这些患者的有效治疗选择。”


进一步探索

研究发现宫颈癌类型的基因组差异

更多信息:Carolyn E. Banister等人,hpv非依赖性宫颈癌的鉴定和特征,Oncotarget(2017)。DOI: 10.18632 / oncotarget.14533
期刊信息: Oncotarget

引用:研究人员发现了新的子宫颈癌亚型(2017,1月10日),检索自2022年7月10日//www.pyrotek-europe.com/news/2017-01-subtype-cervical-cancer.html
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