艾滋病研究人员开发新的方法来“指纹”

艾滋病毒是伪装的高手。病毒使用盾牌的糖分子,称为聚糖,躲避免疫系统并且阻止抗体攻击它。

现在斯克里普斯研究所的科学家们(TSRI)已经开发出一种方法来分析多糖保护艾滋病毒的保护性外糖蛋白,开发潜在的艾滋病病毒疫苗候选人。

通过这种方法,科学家们可以快速创建一个“指纹”的聚糖糖蛋白告诉如果他们在正确的轨道上发展中一个有效的疫苗。

“多糖指纹对艾滋病毒的糖蛋白的识别能力,将帮助我们开发一个相匹配的是什么病毒的疫苗,”詹姆斯·保尔森说主席塞西尔·h·和艾达·m·绿色化学TSRI和分子医学部门的联合主席,领导这项研究发表在《华尔街日报》自然通讯。

打破艾滋病病毒的防御

与新方法,科学家们终于可以看到哪些类型的聚糖构成糖蛋白、糖蛋白是否有任何脆弱的洞。

聚糖覆盖艾滋病毒的糖蛋白机械使用进入宿主细胞。人类的免疫系统想要产生抗体结合糖蛋白阻止感染,但聚糖阻止免疫细胞看到他们的目标和发展有用的抗体。

TSRI,几个研究团队正在设计艾滋病疫苗,提示身体创建罕见的“广泛中和抗体,可以绕过多糖,或糖,盾牌。为此,他们需要引入免疫系统种类艾滋病糖蛋白和教导免疫系统多糖保护的漏洞在哪里。

在新的研究中,研究人员开发了一种方法来找出糖蛋白上的糖组成。他们使用酶来打破糖蛋白为小肽的块。接下来,该团队使用了一种叫做质谱分析这些缩氨酸,看他们是否落入三个类别之一:high-mannose聚糖(用一种特定的糖一种),复杂类型聚糖(更成熟聚糖)或网站没有聚糖。

虽然以前的艾滋病毒研究区分high-mannose和复杂类型聚糖,这是第一次科学家也能看到glycan-free站点的数量。事实上,新方法已经显示,糖蛋白没有尽可能多的漏洞,许多研究人员预测。

新方法还可以节省时间。之前的研究使用质谱肽研究人员手动分析需要结果的过程,可能需要数月之久。联合TSRI教授约翰·耶茨的实验室,研究人员在这项研究中成功地使用了计算机算法快速分析结果相反。

研究第一作者身子曹,保尔森实验室的研究助理,说速度将派上用场,科学家们整理许多艾滋病候选疫苗找到正确的预防各种不断变化的艾滋病毒菌株。

本研究的下一步是分析多糖成分和glycan-free网站自然,或“本地”形式的艾滋病,不仅一种类艾滋病候选疫苗。“然后我们可以看到如果指纹匹配,”保尔森说。如果它们匹配,研究人员就会知道他们是在开发一种疫苗,可以产生有用的抗体。

这种新方法也可以帮助对抗病毒类似糖蛋白盾,比如流感,保尔森解释道。事实上,一项新的研究中,研究人员成功测试了他们的项目方法在流感蛋白质。

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