新的统计分析揭示了数千种与癌症有关的罕见突变

新的统计分析揭示了数千种与癌症有关的罕见突变
发现onCodomain热点的描述与蛋白激酶结构域的活性位点显着重叠。信用:由托马斯A. Peterson,CC的原始图像

科学家们发现了数千以前忽视的遗传突变,虽然罕见,但可能有助于癌症生长。该研究结果可以帮助铺平新治疗方法,发表在PLO计算生物学

癌症是由基因引起的在细胞中导致异常的生长导致肿瘤。一些癌症药物利用这种靶向靶向肿瘤细胞来靶向肿瘤细胞,因为编码它们的基因中的突变,靶向突变的蛋白质。然而,已经确定了对癌症有显着贡献的所有突变的一小部分。

托马斯彼得森,在马里兰州大学和同事开发了一种新的统计分析方法,使用来自癌症患者的遗传数据来寻找癌症突变。与以往的研究相比,重点是个体基因中的突变,新方法解决了相关蛋白质的家庭共享的类似突变。

具体来说,这种新方法关注的是蛋白质子成分的突变域。即使不同的基因编码它们,不同的蛋白质可以共享相同的蛋白质结构域。新的策略利用现有的蛋白质结构域结构和功能的知识来确定肿瘤中更容易发现突变的蛋白质结构域的位置。

利用这种新方法,研究人员发现了数千种罕见的肿瘤突变,它们与其他肿瘤中其他蛋白质的突变发生在相同的结构域位置——这表明它们可能与癌症有关。

“只许两名患者在特定蛋白质中有突变,但是当你意识到它处于完全相同的位置作为癌症患者中其他蛋白质中的突变,“研究Maricel Kann的高级作者,”你意识到调查这两个突变很重要。“

研究人员创造了术语“癌域”来指代更有可能包含致癌突变。对肿瘤结构域的进一步研究可能有助于药物开发:“因为在如此多的蛋白质中,这些结构域是相同的,”Kann说,“因此,一种单一的治疗方法可能可以治疗由广泛的突变蛋白质引起的癌症。”


进一步探索

新的突变可能与非裔美国人前列腺癌有关

更多信息:Peterson Ta,Gauran Iim,Park J,Park D,Kann MG(2017)植物:一种用于分析肿瘤样品中罕见变体的蛋白质域中心框架。PLOS计算BIOL.13(4):E1005428。doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005428
期刊信息: PLO计算生物学

引用:新的统计分析揭示了与癌症(2017年4月20日)相关的数千名罕见突变从HTTPS://medicalXpress.com/news/2017-04-tatisticals-anysis-reveals-thousands-rare.html
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