胃癌超级增强剂的第一个路线图为新的治疗方法铺平了道路
A*STAR研究人员通过绘制来自胃癌肿瘤细胞的近3800个超级增强子的空前目录,找到了一种诊断和治疗胃癌的潜在新方法。
胃或胃A*STAR生物医学研究理事会(BMRC)副执行主任Patrick Tan说,癌症是世界上第五大常见癌症,也是全球第三大癌症死亡原因。bob88体育平台登录
Tan领导的新加坡A*STAR基因组研究所的研究团队绘制了100多个来自新加坡患者的胃肿瘤的表观基因组图谱,并将它们与正常的胃细胞进行了比较。他们使用来自日本、美国和韩国科学机构的胃癌数据验证了这些资料。
Tan说,这项研究为以前的方法所忽视的胃癌提供了新的见解。
表观基因组由附着在DNA上并对其进行指示的化学标记组成。Tan说:“使每种细胞类型不同的是——一种是癌变的,一种不是,实际上是哪种基因打开或关闭。这个过程我们称之为基因表达。”
Tan解释说,增强子是“基因组中的控制电路,它决定哪些元素被打开或关闭”。
最近,研究人员发现了超级增强子:定位于基因组特定区域的增强子集群。它们对基因表达有广泛而强大的影响,是癌症和其他疾病过程的关键。
谭说:“当一个人看着基因表达由超级增强子控制的模式,这些基因的功能都与癌症的不同特征有关,包括对细胞死亡的抵抗和不受控制的增殖。”
研究小组分析了胃癌和匹配的正常样本,调查了近37,000个增强子,发现了3759个预测的超级增强子。这种活性的超级增强子被一种特殊的DNA标签H3K27ac识别。
他们还研究了848名胃癌患者,结果显示,拥有高水平超增强子相关基因的患者存活率比其他患者更差。
研究小组现在将专注于癌症治疗,针对那些允许超级增强子促进胃的因素癌症增长。他们想要开发一种早期诊断的方法胃癌通过这些测试胃癌特殊技能super-enhancers。
该团队计划开设一个实验室,为研究其他癌症和疾病的合作者提供他们开发的表观基因组分析平台。
更多信息:黄文芳等。原发性胃腺癌的表观基因组谱显示超增强子异质性,自然通讯(2016)。DOI: 10.1038 / ncomms12983