2017年7月18日

“超级细菌”研究揭示了大肠杆菌血流感染的复杂情况

第一次大规模的基因研究大肠杆菌（大肠杆菌)从英国血液感染患者身上培养的结果显示，耐药的“超级细菌”并不总是比其他菌株更有竞争力。威康信托基金会桑格研究所及其合作者的研究表明，新型的大肠杆菌经常发生，但与其他一些感染不同的是，耐药菌株不会成为感染的主要原因。

今日出版于基因组研究该研究调查了大量的大肠杆菌从患有血流感染的患者中分离出来已有十多年的时间，其中一些人对许多抗生素具有耐药性，而另一些人则没有。研究人员发现，感染是由200多种不同类型的大肠杆菌引起的。新菌株包括多药耐药大肠杆菌随着时间的推移，这些菌株在种群中出现，但它们很快与种群中的其他菌株达到了平衡，而不是随着时间的推移而增加。

尽管它是人类消化道中自然携带的一种非常常见的细菌，大肠杆菌也是主要原因吗血液感染．2014年英国有35676例病例，通常是由泌尿道或胃肠道感染传播引起的。

某些品种的大肠杆菌已经被广泛研究过，比如对多种抗生素具有耐药性的“超级细菌”菌株ST131。但这项研究采用了不同的方法，而不仅仅是专注于耐药菌株在美国，该研究对1509人的不偏不倚的收集进行了研究大肠杆菌其中大部分来自英国抗菌化疗学会菌血症监测项目，该项目收集了英国各地超过11年的时间。通过全基因组测序，研究人员发现了228种不同的大肠杆菌在这个集合里。

该研究记录了ST131在英国出现的那一年(2002年)。在短时间内，ST131分离株数量与其他类型达到平衡。大约在同一时间，另一种类型(ST69，不是多药耐药菌株)也出现了，并再次在总体人群中迅速达到平衡。

来自维康信托基金会桑格研究所和伦敦卫生与热带医学学院的沙伦·皮科克教授说:“这些研究结果表明，新型流感的出现大肠杆菌并不罕见，而且必然会与其他类型的病毒成功竞争，从而成为人类感染的主要原因。这种平衡的原因可能与这样一个事实有关:所有的细菌都在不断地与其他细菌竞争，以在它们携带的地方生存，比如肠道。”

研究发现，五种菌株占了分离物收集的一半以上。“超级细菌”ST131是第二常见的菌株，而对抗生素敏感的菌株ST73是最常见的。研究人员发现，不同的菌株携带不同的基因组，这些基因可能是它们成功的基础。其中许多是使它们能够在肠道或尿道中存活的毒力基因，但也有一些是使它们能够通过清除营养物质或直接杀死竞争对手与其他细菌更好地竞争的基因。

桑格研究所的朱利安·帕克希尔博士说:“我们的研究表明，不同菌株的成功有很多原因大肠杆菌，其中包括细菌之间的竞争，以及与人类宿主的相互作用和抗生素耐药性。这表明，最终的来源大肠杆菌导致血液感染的是更广泛的社区中不同的细菌种群。”

的多样性大肠杆菌与另一种引起常见医院感染的细菌——耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)形成鲜明对比。这是一种多药耐药细菌，在任何时候都有一种MRSA菌株占主导地位。这种微生物在医院环境中在病人之间传播，减少医院传播已被证明有助于预防MRSA感染．还需要进一步的研究，但这项研究表明可能需要一种不同的策略来帮助减少大肠杆菌血液感染。