综合排序程序显示了晚期癌症精密医学的承诺

平均转移性癌基因突变比在早期肿瘤,一项新的研究发现。

这意味着什么:精密医学癌症治疗的现实,你需要一个实时、全面的方法,看了转移性肿瘤和序列的详细程度超出了大多数商业测试。

最大和最全面的努力检查晚期癌症的遗传和分子景观,密歇根大学综合癌症中心的研究人员测序DNA和RNA的500例转移性癌症。结果发表在自然。

使这种分析独特的三件事:

• 研究人员获得新鲜活检对大多数患者来说,提取样本转移性肿瘤,而不是主要的肿瘤。
• 测序DNA和RNA。
• 他们比较了癌组织正常病人的DNA。

“这是一个更全面的方法比大多数商用临床测序项目。我们的结果显示值在某种程度上这更详细的方法,“高级研究作者Arul Chinnaiyan,医学博士博士,临床病理中心的主任。

数据反映了前500个患者实体肿瘤参加密歇根肿瘤学测序计划,研究协议,它始于2010年,测序DNA和RNA的转移性肿瘤和正常组织,以确定变化可能有助于治疗。这个项目包括一个精密医学专家讨论每种情况下的肿瘤的董事会。Mi-ONCOSEQ是最早全面临床测序项目提供癌症患者。

病人的表示自然纸跨越了30多个类型的癌症,在22个不同器官转移。它只包含成人固体肿瘤,尽管Mi-ONCOSEQ可用血液癌症和儿童患者。

肿瘤活检转移,而不是存档

研究人员发现显著增加的数量和类型病人的转移性癌症和主之间的突变。几乎每一个转移性癌有更多的突变的情况下,他们发现。这可能反映了转移性癌症更激进的:他们有更多的时间来开发额外的突变,和治疗为了杀死癌症造成更多的突变。

“我们的研究结果强调的重要性得到新鲜的活组织检查转移性肿瘤”,Chinnaiyan说。“肿瘤演进的转移和治疗的一部分。我们需要活组织检查转移性肿瘤,然后暗示疗法,而不是使用档案从原发肿瘤组织。”

RNA序列揭示了更多的目标

的另一个关键组件是RNA和DNA测序。这个更广泛的方法揭示了宿主的分子在肿瘤微环境中发挥作用的因素,培养和允许癌症继续增长,传播或逃避治疗。

一般来说,大多数临床测序的努力集中在DNA测序。而DNA测序揭示基因改变参与转移性癌症,研究人员发现RNA序列揭示底层机制,打开致癌基因或关掉旨在阻止癌症的基因。他们的发现可以帮助识别潜在的治疗目标。

此外,通过观察RNA,研究人员可以检查肿瘤微环境中的免疫细胞,这提供了线索,为什么免疫治疗可能对有些病人而不是为别人工作。

“理解免疫微环境细胞浸润肿瘤的类型和他们的表达,是很重要的。它给了我们一幅immuno-phenotype。我们的假设是我们可以用这个来帮助确定谁可能对免疫疗法,“Chinnaiyan指出,还需要更多的研究在这个领域。

另一个重要发现是,转移性肿瘤表现出两种互斥的签名。高度增殖的一个版本,这意味着积极地增加。在其他版本中,细胞失去分化,称为上皮间充质过渡的状态。

“不是所有的转移都是相同的。不同的途径使他们完全不同,高度增殖和那些区分。这个互斥的方面是一个惊人的发现,可以指导我们在开发新类型的疗法,”Chinnaiyan说。

遗传突变的发现

另一个惊人的发现是,12%的转移性癌症患者拥有一种遗传突变。这是大约四可能会在所有癌症患者。这些突变被确定通过比较肿瘤DNA正常的DNA。

约四分之三的这些突变相关的DNA修复的过程中,几个现有的疗法的设计目标。

“有很大一部分转移性癌症的遗传突变。一旦这些突变确定,有可能别人在家庭也可能携带该基因,在更高的风险癌症”,Chinnaiyan说。

家庭成员可能寻求遗传咨询或额外的检查,如果合适。病人Mi-ONCOSEQ收到遗传咨询,也延伸到他们的家庭的遗传突变。

研究人员目前正在分析从这个初始组病人的结果。初步数据显示今年早些时候举行的美国临床肿瘤学会年会上表示,四分之三的被测序的肿瘤患者有一个“可行的突变,“意义治疗存在目标特定的畸变。总的来说,近2300人病人有参加Mi-ONCOSEQ日期。