寻找BRCAness在乳腺癌的“签名”的原因
乳腺癌细胞DNA损伤与缺陷修复基因BRCA1和BRCA2突变签名(swaps-e.g模式的基础。Ts Gs,纵观整个基因组Cs)在癌症基因组学称为“签名3。”But not all breast tumor cells exhibiting Signature 3 have BRCA1 or BRCA2 mutations. Therefore, some consider Signature 3 a biomarker for "BRCAness," a sign of a breakdown in BRCA-related DNA repair (a process called homologous recombination, or HR) in general and not BRCA damage in particular.
问题是,还有什么可能会禁用人力资源和产生签名3 ?除此之外,可能签名3有一个角色在诊所吗?
为了找到答案,一个国际研究小组由巴斯波兰人,Jaegil Kim Lior创办人和迦得斯坦利·Broad研究所癌症计划和麦吉尔大学的威廉·福尔再分析数据来自近1000个乳腺癌收集的肿瘤癌症基因组图谱(TCGA)。他们的研究结果,发表在自然遗传学,暗示突变签名签名3可能燃料精密医学方法,使用一个肿瘤的突变指导风险的范围治疗决策,而不是专注于单个基因。
乳房肿瘤表现出签名3中,研究人员发现:
- 与生殖系肿瘤(遗传)或体细胞(收购)BRCA1或BRCA2突变绝大多数阳性签名3。是肿瘤也是如此遗传突变在PALB2基因工程与BRCA1和BRCA2音乐会。
- 缺陷在ATM或CHEK2(两个基因,提醒细胞DNA损伤,并可港乳腺癌冒险提高生殖系变异)没有与签名3。
- 表达RAD51C(另一个BRCA1/2伙伴)epigenetically在几个肿瘤阻塞。这个迄今为止还不了解的人力资源功能障碍机制是更常见的官腔年轻的非裔美国女性的乳房肿瘤的数据集比白人女性,就像后生BRCA1基因沉默(已知签名3司机)。mutation-based司机的情况却相反。
签名3的临床效用呢?研究小组发现,他们可以把签名的存在与否乳腺癌细胞与其他数据分类稀有BRCA1和BRCA2突变是有害的,发现他们指出需要进一步调查。研究人员还建议签名3可能有一天为乳腺癌患者治疗的决定因素,或帮助开发未来的“BRCAness”针对治疗。