新乳房细胞类型由多学科的研究小组发现的
乳腺癌研究人员的共同努力下,bioinformaticians提供了新的见解的分子变化,驱动乳房发育。
该研究小组比较基因表达单个细胞在乳腺(乳腺组织)了解广泛的分子在开发过程中发生的变化。这揭示了一个戏剧性的转变在青春期发病的基因表达,并允许团队识别先前未被发现的细胞类型的细胞乳房。
乍一看
- 从干细胞乳房发育,戏剧性的变化发生在青春期乳腺准备牛奶产量。
- 我们的研究人员发现许多相似之处正常乳房发育乳腺癌形成。
- 使用一个名为单细胞转录组的新技术,一个多学科研究团队能够定义未知的发展中乳腺癌的基因表达的变化。
乳房是如何发展的?
Bhupinder朋友博士一个研究所的研究小组包括Yunshun陈和弗朗索瓦•维兰特博士领导的简Visvader教授戈登史密斯教授和教授杰夫·林德曼的调查分子变化出现乳房发育。他们的研究发表在自然通讯。
Visvader教授共同导致的乳腺癌研究程序与林德曼教授说,团队专注于乳房的变化之前,期间和之后青春期。“我们比它所表达的基因乳腺癌细胞——他们的转录组——在全球层面上分析成千上万的细胞,”她说。“这让我们发现一个巨大的变化发生在青春期的转录程序,这是细胞的时候提交成为不同类型的成熟细胞。在此时间之前,pre-pubertal乳房,细胞都是在一个相对类似的和不成熟的状态。”
Visvader教授说,研究结果对理解乳腺癌产生了重要的影响。
“这种技术可以应用于理解细胞出错的女性患乳腺癌的风险增加。此外,这种技术提供了一种新方法研究乳腺癌的异质性在更大的深度,“Visvader教授说。
放大单个细胞
关键的发现是一种新技术叫做单细胞RNA-sequencing,研究者能确定到成千上万的细胞的转录组,戈登史密斯教授说,研究所的生物信息学。
“我们能够运用我们的专业知识在生物信息学来区分不同人群的乳腺癌细胞,”史密斯教授说。“这揭示了引人注目的变化基因表达程序,导致乳房发育。"
这项研究的一个重要方面是,它使用了两个不同的转录组技术研究所。一个技术平台启用深度测序数以百计的细胞,而另一个使成千上万的细胞被测序,尽管在深度。
“这种双重方法使用两个测序平台允许我们全面调查研究问题,更胜于我们可以单独使用的平台,”史密斯教授说。
合作的力量
林德曼教授说,这项研究是一个了不起的成功故事之间多学科协作的生物学家,bioinformaticians和技术专家。研究所“跨多个部门专业知识是我们团队的重要发现,”林德曼教授说。
“生物学的未来在于合作和在应用新技术解决复杂问题和揭示新水平的细节在我们的身体是如何工作的。这是多学科研究的实力和潜力的一个例子。”