新方法识别剪接肝癌的生物标志物

因为肝癌尤其不同,基因,而且容易复发,标志物可以预测疾病进展是一个关键的目标对抗它。

冷泉港实验室的研究人员(3),由3艾德里安教授报告,现在报告基因组研究,他们已经开发出一种splicing-based标志物的方法,最常见的肝癌,肝细胞癌(HCC)。他们认为该方法在其它癌症也会有用的。

“这项研究强调了学习潜力RNA剪接变体可以导致癌症和指向这些变体作为癌症恶化的潜在生物标记,”报告说。

拼接是指一个过程,一个RNA信息从信息编码的基因复制编辑之前能够作为蓝图制造特定的蛋白质。RNA基因可以产生多个消息,导致不同蛋白变体,或者“同种型”。Many diseases have been associated with errors or variations in the way that RNA is spliced. Errors or variations in splicing can lead to non-functional proteins or proteins with distinct or aberrant functions.

最近的研究已经确定了拼接不规则肝癌细胞。由3博士后研究员内门乡观亭林,报告的团队开发了一种方法,综合分析所有RNA消息由一个给定的基因。测试团队在HCC splicing-variant检测方法,通过分析肝癌细胞中RNA信息采样的病人。

他们发现,特定的拼接亚型的基因AFMID与非常贫穷的病人的生存。这些变异导致细胞制造的截断版本AFMID蛋白质。这些不寻常的版本的蛋白质在成人相关肝癌细胞与肿瘤抑制基因突变基因叫TP53, ARID1A。

研究人员猜测,这些突变与低水平的分子称为NAD +参与修复受损的DNA。恢复丢失的部分,称为外显子,AFMID正常RNA的消息,他们建议,可能NAD +提高到正常水平,避免TP53和ARID1A突变。团队希望利用小分子叫做ASOs(反义寡核苷酸),可以绑定到RNA,改变AFMID RNA拼接消息的方式。报告的团队之前使用这种技术来纠正错误的拼接SMN2基因来治疗脊髓性肌萎缩(SMA)。

修复AFMID剪接可能导致增强生产NAD +和DNA修复的增加。“如果我们能做到这一点,AFMID拼接可以成为治疗目标和肝癌的新药物的来源,”林说。初步实验表明团队在正确的轨道上。它们表明,哄骗细胞过表达AFMID拼接以正常的方式导致了更高的NAD +水平和经济增长放缓肝癌细胞。