“隐藏”司机发现有助于主要抗肿瘤免疫反应

像揭露犯罪老板的权威已经发现,圣裘德儿童研究医院的科学家们发现了一个隐藏的司机,影响生产对抗癌症和感染的T细胞。这项研究发表今天提前在线发表在《华尔街日报》自然。

隐藏的司机激酶(酶)Mst1 Mst2。研究人员显示Mst1和Mst2共同调节函数不同的树突细胞类型(子集)。树突细胞适应性免疫系统的主要监管机构,包括T细胞的癌症免疫疗法的核心。

“树突状细胞激活适应性的关键免疫反应,包括启动抗肿瘤的T细胞,”张洪波说Chi,博士,免疫学圣裘德部门的成员。“但监管的不同功能不同的树突细胞子集知之甚少。我们想要改变这种情况。

“这些发现为新的癌症治疗策略提供线索或免疫紊乱调节的活动树突细胞塑造免疫反应,”气说,谁是共同通讯作者,研究吉阳Yu博士,助理圣裘德计算生物学部门的成员。Xingrong杜博士,博士后研究员的实验室,是第一作者。

采用系统的方法

一个数据驱动,系统生物学的算法称为NetBID发挥了关键作用的研究。于和他的同事们开发NetBID,短数据驱动的基于网络的贝叶斯推理的司机。

于和他的团队整合的基因表达,蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学太极的实验室和其他来源的数据在小鼠树突状细胞逆向工程生物网络。研究人员使用NetBID分析网络的差异不同的树突细胞亚型。令他们吃惊的是,Mst1/2和河马的信号通路成为关键调节器树突状细胞功能和T细胞的免疫应答。

“河马途径以调节器官大小的动物,不是在树突细胞免疫功能,“气说。相比于Mst1/2犯罪的老板是几层下属背后隐藏的作用。“数据驱动的系统方法给了我们一个方法发现隐藏的司机,树突状细胞的基础微分功能子集,”Yu说。

跨学科合作研究至关重要,气补充道。

代谢和信号

这项研究集中在树突细胞有不同的子集对免疫系统的影响。CD8α+树突细胞,启动生产CD8 T细胞对抗肿瘤和感染的核心。,CD8α树突细胞,启动生产不同的T细胞亚型。

研究人员在不同的树突细胞代谢活动相比,发现CD8α+树突细胞比CD8α-树突细胞代谢更为活跃。他们到达这一结论通过比较氧代谢细胞的发电厂,线粒体。调查还显示,操纵代谢影响CD8α+树突状细胞功能和T细胞的启动。

“虽然代谢通常被认为是重要的免疫反应,本研究定义,我们认为第一次,它不仅是重要的在树突状细胞的功能,但是这两个树突细胞具有不同的子集新陈代谢由河马控制信号,“气说。“此外,我们表明,操纵树突细胞的新陈代谢直接影响功能子集。”

研究还表明,Mst1/2细胞因子信号传导中发挥了关键作用,为启动T细胞是至关重要的,确保一个健壮的免疫反应。细胞因子分泌的小分子调节免疫应答。

而不是通过传统的信号通路,调查人员表明Mst1/2需要非常规路线' T细胞。Mst1/2使用NF-κB信号通路而非公约途径触发细胞因子的生产interleukin-12 (il - 12)。白介素促进CD8α+树突状细胞功能和质数CD8 T细胞反应。

“研究表明,Mst1/2集成代谢活动和细胞因子信号选择性驱动CD8α+树突状细胞的功能,“气说。

“NetBID算法可用于我的其他数据集隐藏的司机和探索生物问题,”Yu说。《算法已被用于分析网络之间的差异不同的癌症亚型或耐药和敏感的癌症患者潜在的治疗靶点和生物标记的识别。关键是数据驱动和上下文特定的网络,”他说。