单细胞RNA测序发现新的视网膜神经节细胞亚型

单细胞测序技术正在填补生命目录的细节。康涅狄格大学健康中心(UConn Health)和杰克逊实验室(JAX)的研究人员已经确定了视网膜神经节细胞(RGCs)的40种亚型，以及区分它们的遗传标记和转录因子。

多亏了基于液滴的单细胞RNA测序技术的最新进展，研究人员现在可以分离单个细胞细胞并放大它们的遗传物质，以探测它们的全部RNA补体。这使得对特定类型的细胞(如rgc)进行详细的普查成为可能，从而确定构成子类型的细微分子差异。

rgc将视觉数据从眼睛传输到大脑，此前已经确定了30个亚型。通过单细胞RNA测序，研究小组分析了6225个rgc，从新生小鼠的左右眼睛中检测出每个细胞约5000个基因表达。通过聚类算法运行得到的数据，将细胞分类为40个子类型。

康涅狄格大学卫生系神经科学系的Ephraim F. Trakhtenberg博士领导了这个研究团队，其中包括JAX单细胞生物学主任Paul Robson博士。他们的研究发表在自然通讯，为生物学中的一个重大问题提供了新的精确度:是什么构成了细胞类型或子类型?

哺乳动物中枢神经系统是高度复杂的，涉及许多专门的神经元类型和亚型的相互作用。研究小组之所以选择rgc，正是因为与其他主要神经元细胞类型相比，迄今为止已经确定了更多的rgc亚型，也因为其他广泛的视网膜细胞类型(如光感受器)已经在单细胞水平上进行了研究。他们的目标是阐明RGC亚型之间的分子差异和独特的标记。

除了识别新的RGC亚型和它们的标记外，研究人员还展示了将它们区分为亚型所需的细胞之间的基因表达可变性的数量，并提出了从细胞类型种群到亚型的层次结构。该研究的数据集可通过用户友好的康涅狄格大学健康网站应用程序RGC亚型基因浏览器公开获取。

---

---