研究人员解决几十年来最常见的突变基因在癌症之谜
最常见的突变基因在癌症的消息激起了科学家们几十年的突变。尽管突变可以发生在超过1100个网站在TP53基因,他们用最大频率出现少量的点称为“热点”。Does this imbalance suggest that hotspot mutations are especially conducive to cancer or that they're particularly disabling to TP53? What does the plethora of mutations at hot spots tell scientists about the role of TP53 within cells and about the ability of certain mutations to disrupt that role?
在今天发表的一项研究自然遗传学丹纳-法伯癌症研究中心的研究人员,麻省理工和哈佛大学和其他机构显示,热点突变不是如此特别,后即不再癌症比许多其他突变促进,仅仅是工件的过程获得突变的细胞。发现,涉及每一个可能在TP53突变和测试所有的细胞,导致创建一个在线工具,医生和研究人员可以使用它来学习他们遇到的任何TP53突变的影响。
”作为肿瘤越来越测序确定突变容易靶向治疗,重要的是我们能够知道这些突变的功能以及它们是如何影响肿瘤细胞,”威廉·哈恩说,这项研究的资深作者,副首席科学官丹纳-法伯癌症研究所成员广泛的计划,和布莱根妇女医院的教员。“TP53的我们的工作表明,这些信息可以被编译任何基因。”
TP53是一种肿瘤抑制基因,通过抑制细胞分裂和阻止细胞生长和增殖失控。当mutated-when基因内的DNA密码错拼基因可能失去正常功能,允许细胞生长泛滥成灾。TP53突变被发现在几乎所有类型的癌症,在卵巢的利率高达50%,食管、结肠直肠,头部和颈部,喉和肺癌。人与生俱来的基因的突变形式的风险异常高的发展中一个数组不同的癌症。
理论上虽然突变可以出现在任何地方的DNA链包括TP53-and成百上千的这种突变被发现在肿瘤samples-mutations更可能发生在5或6比其他地方热点。研究人员推测,癌细胞可能支持热点突变,因为这种尤其禁用TP53突变,削弱其对细胞生长的控制超过其他突变。有些人认为因为热点突变中常见的一种致癌基因刺激癌症growth-TP53可能迄今未被探测到致癌作用。
解决这些问题,哈恩和他的同事使用技术不可用几年前创建一个图书馆的8258个变异TP53代表所有可能出现的突变基因。变体被放置在细胞上看到他们会有什么影响细胞生长。
“我们发现热点突变没有更多oncogenic-no更有可能促进癌症的许多其他突变,”哈恩言论。“变异的趋势出现的热点,相反,与突变发生的过程。
“各种因素会导致mutations-ultraviolet光,能损伤dna的化学物质,等等,”哈恩解释道。“某些致癌物质(致癌物质)往往针对特定的DNA sequences-specifically,那些更容易突变的序列。数组TP53突变,我们看到的反映细胞的致癌物质暴露的本质。”
体内不同组织往往是不同carcinogens-lung细胞致癌物质暴露于烟草烟雾,例如,或结肠细胞食物中的致癌物质。研究人员使用他们所收集的数据来预测TP53突变的频率会出现在不同种类的癌症。当他们匹配预测对在线数据TP53突变的患病率在不同癌症类型,他们的预测被证实。
“这表明我们正确,TP53突变的重点是确定的热点因为这些斑点是具体的目标细胞接触致癌物质,”哈恩说。“理解具体所扮演的角色突变在癌症相关基因将变得越来越重要,因为基因测序在癌症治疗需要在更大的作用。我们的工作是朝着这个目标迈进的重要一步。”
更多信息:安德鲁·o·贾科梅利et al .突变过程形状TP53突变在人类癌症的景观,自然遗传学(2018)。DOI: 10.1038 / s41588 - 018 - 0204 - y