哥伦比亚大学教授使用科学数据来创建个性化的癌症疗法

哥伦比亚Andrea Califano已经开发了一种高度预测的计算机平台,可以分析所有的肿瘤类型和预测哪些药物或药物将是最有效的治疗。

Califano的实验室发现了监管机构在这些所谓的主人肿瘤细胞通过使用先进的数据科学技术。他们首先使用数学的一个分支叫做“信息论”来识别GEP-NET的每一个蛋白的基因受细胞,这样就建立了一个基因调控网络,这种类型的肿瘤。然后他们使用VIPER算法a方法类似于射线跟踪,即。,跟踪每一个光线从物体表面源照明。使用的技术是电影产业呈现真实的三维物体。毒蛇允许团队向后导航通过基因调控网络来识别特定的蛋白质,身体控制病人的分子签名肿瘤。这些都是至关重要的蛋白质被称为主监管机构。Califano实验室和Modlin领导合作这个研究组的研究与哥伦比亚的病理学和细胞生物学,哥伦比亚的泌尿外科部门,广泛的哈佛和麻省理工学院以及其他17个研究机构。

“这项研究代表了第一个概念证明可能成为一个有价值的新工具提供一个有效的、系统的precision-medicine方法癌症病人Califano说,克莱德和海伦吴教授化学和系统生物学和系统生物学系主任欧文在哥伦比亚大学医学中心(CUIMC)。他也是一个成员的数据科学研究所的健康在哥伦比亚大学分析中心。

Califano CUIMC也是一个研究小组的一部分,最近收到了2018前列腺癌基金会(PCF)挑战奖前列腺癌基金会促进前列腺癌研究通过研究主监管机构,衬底tumor-micro环境交互转移性前列腺癌。另外两个主要调查人员Michael沈和查尔斯·德雷克。这三个研究人员将结合他们的专业知识在系统生物学、基础科学、免疫学、病理学和医学发展precision-medicine治疗目标前列腺肿瘤微环境。

Califano另外的实验室开发了一种计算框架,称为OncoTreat,可以预测药物或药物抑制主监管机构的活动。他说,通常同一cancer-driving的蛋白质主监管机构,称他的团队发现了一个癌症类型的活跃在不同种类的癌症患者,评估团队的分析的基础上从二万多名患者肿瘤组织。肿瘤组织是癌症基因组图谱库的一部分由国家癌症研究所组装。团队也进行了小鼠实验,以确定哪些120年fda批准的药物和340年的实验证明化合物对癌细胞有效的针对他们的主要调控蛋白质。这些实验还允许团队开发计算机OncoTreat算法,然后推荐治疗癌症患者基于特定的主监管机构驱动肿瘤蛋白质。OncoTreat算法以及毒蛇已发表的一系列论文Califano的实验室。

Califano研究获得国家认可。他最近当选为国家医学研究院的工作主监管机构。基于他的研究发现,美国食品和药物管理局最近批准了一项临床试验在哥伦比亚GEP-NET患者。在初始阶段的试验中,几十个这种类型的神经内分泌肿瘤患者将由Califano蛋白质水平评估的团队。他的实验室还将测试药物,entinostat,预测准确的目标主调节器蛋白质大约三分之一的病人。他们还将寻求识别额外的药物,可能会帮助患者缺乏具体的主监管机构。胰腺癌患者的另一个临床试验,由lustgarte基金会(他的实验室将与CUIMC能够专家Kenneth橄榄油和肿瘤学家在中心OncoTreat测试药物预测是有效的,唯一的测试,用来预测药物匹配10侵略性的肿瘤患者使用肿瘤RNA概要文件。这些肿瘤包括卵巢、乳房、胰腺、前列腺、膀胱和肺癌,以及脑膜瘤、肉瘤、恶性胶质瘤和GEP-NETs。测试被DarwinHealth联合,precision-oncology公司源于Califano实验室和哥伦比亚的病理学和细胞生物学。

Onco治疗,收到了临床实验室改进修正案(CLIA)由纽约州卫生部认证,也都在测试6临床试验1,包括一个创新RNA-based“N”在CUIMC学习。研究重点是迅速上升的恶性肿瘤病人未能应对传统或靶向治疗。这项研究的目的是确定和提供癌症患者更有效的和个性化的治疗。2018年12月18日,厦门Encheng集团有限公司制药服务和精密medicine-focused公司位于厦门市,中国宣布进入DarwinHealth的战略伙伴关系。Encheng集团专门将独家许可DarwinOncoTarget和DarwinOncoTreat测试作为多年的一部分协议,授予Encheng权利部署、评估、和市场在大中华地区,包括香港,澳门和台湾。

总的来说,Califano很高兴他的实验室取得的进步在分析肿瘤的监管网络,他说已经证明是一个非常有前途的方法来评估和治疗癌症,“不可知论者其突变状态,甚至是其典型的器官器官分类。”

”这种方法尤其有前途的侵略性的肿瘤患者缺乏可操作的DNA突变,“Califano补充道。”它也将帮助病人无法应对靶向抑制剂或immune-checkpoint抑制剂或复发后最初反应标准药物治疗。这些病人,不幸的是代表大多数侵略性肿瘤病例,现在几乎没有有效的治疗选择。我们认为OncoTreat耗尽时将提供肿瘤学家选择批准therapies-alternatives上而不是基于猜测越来越机械化的阻止癌细胞监管和药物反应的理解,最终,我们希望让生物更精确地预测科学治疗癌症。”