2019年2月28日

跨学科方法揭示了新线索来触发肠道炎症

由Quadram Institute.

关于在对健康肠道至关重要的细胞中损害钥匙细胞过程的情况下发生了什么新细节已经被广泛的分析揭示了。

Paneth细胞位于肠道内隐窝的底部。它们有助于抵御病原微生物，并保护肠道内壁的完整性。这些功能的实现依赖于它们能够分泌抗菌因子和其他分子，以确保一个平衡的肠道微生物群和功能干细胞再生肠道衬里。鉴于他们至关重要的作用，甘蔗细胞异常与肠道病如肠道病如肠道病症有关。

当调用细胞进程时也会出现类似的症状自噬功能失调。通过围绕膜“袋子”中的违规物体，可以使用自噬用于除去缺陷和潜在有害的蛋白质，然后在膜“袋子”中被标记为破坏。Paneth细胞还使用该机制来加入抗微生物分子以响应于致病微生物的攻击而从细胞出口。

这项新的研究旨在填补我们对大众细胞的自噬损伤影响的理解，并由塔马斯库马罗斯博士领导，由四议院研究所和厄厄姆研究所的研究员，由生物技术和厄运学院进行战略资助生物科学研究理事会。

Tamas从挪威研究公园汇集了一个跨学科团队，探讨了群众群体中的自噬被阻止时看到的分子变化，并且这些变化可能具有更广泛的影响。这涉及集成多个不同的数据集并使用网络分析和计算生物学来解释这些改变对单元格内不同函数的影响。

研究人员使用小鼠的细胞在实验室中种植有机体培养物。这些是三维细胞收集，这些细胞生长并将自己组织成隐窝，因为它们会在肠道的衬里。在其中一些中，淘汰自噬所需的中央基因。通过比较，为了用全功分动的基因有机体，然后，该团队首次制定受碱细胞中受损受损影响影响的分子机制和细胞过程。

首先，该团队测量了细胞产生的所有不同蛋白质的水平，并确定了根据自噬基因是否具有功能性而在丰度中改变的那些蛋白质。

这鉴定了280多种蛋白质，这反映了自噬的核心重要性，但导致这些蛋白质具有哪些功能的问题。为了回答这一点，找出自噬在一起时损害的蜂窝功能，研究人员转向网络科学和计算系统生物学。

这科学文学包含单个蛋白质交互，信号传导途径及其各个功能的方式的大量数据。在单元格内部，所有这些过程都是同时发生的，作为维护细胞的复杂信号和指令的复杂网络的一部分，并允许其执行其工作。研究人员综合了许多不同的网络，并使用实验数据Tolink蛋白质，以改变的丰富改变了这些网络内的功能。这鉴定了至少18个受自噬影响的蜂窝功能。其中一些已经知道了，验证了这种方法，但其他人以前是未知的。允许受损细胞杀死自己的细胞凋亡似乎在自噬障碍的群体细胞中被下调。由于下调的细胞凋亡可以保持受损的细胞活着，这可以解释慢性炎症疾病（如克罗恩疾病发展）的关键机制，因此这可能是进一步研究的有趣区域。系统本周细胞用于释放抗菌化合物，胞吐作用也被下调，这将影响抵御微生物入侵的防御机制。