基因组分析为高危白血病的诊断和治疗提供了路线图
急性白血病红细胞(AEL)是一项高风险的癌症的预后,不确定的遗传基础和争议的诊断。这种情况正在改变,由于研究由圣裘德儿童研究医院,今天出现在杂志上自然遗传学。
研究人员完成了最大,最全面的基因组分析AEL确定六个与年龄相关的子组和不同的突变和基因表达模式以及治疗结果。
分析显示,45%的患者的突变信号通路,帮助驱动不受控制的细胞生长。调查人员还报告证据表明白血病药物可能容易受到现有精度。
“基因变化和基因表达谱是最靠谱的结果AEL患者,这意味着他们应该被纳入诊断和预后标准,“说通讯作者查尔斯•Mullighan面交,医学博士圣裘德病理部门的成员。
“这些结果标志着一个新时代的理解和治疗AEL,咄咄逼人的白血病已经饱受诊断争议和糟糕的结果,”他说。
AEL是一种罕见的亚型急性髓系白血病在成人比儿童更常见。AEL往往是对传统疗法和整体长期生存还不到10%。
重新定义AEL
光谱的分类AEL骨髓白血病白血病以来一直挑战是第一次描述了近一个世纪以前的事了。的诊断标准改变了几十年来,最近一次是在2016年,但AEL的基因基础仍不确定。因此,2016年,某些情况下一旦定义为AEL被重新归类为AML或骨髓增生异常综合征(MDS)。AEL、AML和MDS骨髓癌症或癌症的骨髓细胞,但需要不同治疗方法的强度明显不同。
这项研究的研究人员比较了突变的159名儿童和成人患者诊断为AEL 1903 non-AEL骨髓疾病,包括AML和MDS。分析包括整个基因组,全外显子组或全转录组测序数据。病人是来自美国、欧洲、新加坡、日本和澳大利亚。他们从婴儿到成人60岁以上不等。
生物学
“我们发现患者AEL, AML和MDS许多相同的突变,但突变的频率和模式是截然不同的,”第一作者说Ilaria雅克布奇,博士,Mullighan实验室的一名科学家。“研究结果证明AEL是一种特定亚型,并提供深入了解疾病过程和结果在儿童和成人不同。”
例如,改变一个或两个拷贝的肿瘤抑制基因TP53 AEL子集的一个标志,几乎只发生在老年人。子集占32%的情况下分析和与低迷的预后有关。没有长期的幸存者。
相比之下,约12%的成人患者群定义的NPM1基因的突变,预后良好。超过87%的患者长期的幸存者。
这些都是基因组的改变定义了其他AEL子组:
- NUP98(重新)
- KMT2A(突变或重新安排)
- DDX41(突变)
- 其他(缺乏经常性的创始遗传改变)
精密医学
“标识的基因基础AEL也导致新的治疗靶点的识别信号通路和早期的有效性的证据,”合著者Torsten Haferlach说,医学博士MLL慕尼黑白血病的实验室。激酶帮助调节基因活性和癌症中经常突变。
例如,AEL包括TP53突变的小鼠模型和NTRK1,激酶信号通路,是抑制剂larotrectinib敏感。AEL仍无法觉察的小鼠治疗后至少三个月。
“结果突出这类抑制剂的潜在作用在未来的临床试验,“Mullighan说。
更多信息:自然遗传学(2019)。DOI: 10.1038 / s41588 - 019 - 0375 - 1