研究人员开发工具来估计遗传多样性和细胞系的祖先
癌症是一种高度多样化的疾病，在不同的肿瘤类型、个体和祖先群体之间具有遗传差异。这些基因差异会影响疾病的侵袭性、疾病类型和对治疗的反应。重要的是，科学家有适当的工具和模型系统来研究这些变异如何影响癌症的发展，并为所有基因背景的患者设计有效的治疗方法。发表在癌症研究莫菲特癌症中心的研究人员与波多黎各庞塞健康科学大学(Ponce Health Sciences University)的科学家合作，通过创建一个在线工具来研究这个问题，科学家可以使用该工具来确定1300多个不同细胞系的遗传祖先起源。
在癌症研究中,细胞系从患者建立的肿瘤被用于实验室实验作为模型系统，以了解癌症的分子和细胞基础，确定治疗靶点和开发新的治疗方法。然而，这些细胞系的遗传祖先通常是未知的或不完整的。因此，科学数据可能无法准确反映世界各地存在的不同人群，导致对不同人群的患者管理和治疗效果较差。
研究小组通过对1393人的遗传祖先进行了广泛的分析，以改善这一知识差距癌症细胞系根据已知的人口。他们发现，这些常用的细胞系并不能代表人类人口的多样性祖先。欧洲细胞株占62.46%，东亚细胞株占29.18%。所有其他人群的细胞系所占比例不到10%，包括5.26%的非洲裔、0.86%的非洲裔和1.95%的西班牙裔/拉丁裔。此外,许多祖先的人群在特定癌症类型的细胞系中基本不存在或代表性不足。例如，非裔美国人被诊断患有前列腺癌他们比其他人群有更高的死于该病的风险。然而，10个前列腺癌细胞株中只有1个被发现代表非洲祖先的遗传因子。
根据他们获得的信息，该团队创建了一个基于网络的在线交互式工具，允许研究人员确定细胞系的遗传祖先。“这些信息可以被科学家用作数据和可视化工具，以显示他们用于实验的细胞系的遗传祖先，”Steven Eschrich博士说，他是这篇文章的第一作者，也是莫菲特生物统计和生物信息系的高级成员。“我们相信，这一代表不同祖先的新工具将成为减少不同祖先群体之间存在的疾病预防和治疗知识差距的重要资源。”
“我们希望这一资源能够让研究人员获得细胞系模型中的祖先，并有助于解决存在明显差异的癌症类型代表性不足的问题。在细胞系中加入估计的遗传祖先分子生物学而药物发现研究可以显著提高研究的严谨性、可重复性和相关性癌症研究活动，而不仅仅是那些明确检查基因祖先在癌症生物学中的作用的活动，”庞塞健康科学大学教授Julie Dutil博士说。
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