研究人员在我们年龄龄的常规细胞中造成的突变突变

细胞分裂并不完美。随着年龄的增长，突变通常在正常细胞中出现在基因中。大多数这些突变的细胞和它们的后代被称为“体细胞克隆” - 对我们的健康没有影响，但微小的部分可以帮助触发癌症生长或有助于诸如心血管疾病的其他条件。由广泛的研究所的癌症计划和马萨诸塞州普通医院（MGH）领导的团队现在创造了一种强大的新方法，通过分析来自正常组织的RNA测序数据来检测许多不同类型正常细胞的突变。

“这是第一研究，分析许多常规细胞中基因突变景观的研究人类组织，“Keren Yizhak，Proddoctoral Somell和Lead作者说科学纸张介绍工作。

其他研究组先前使用DNA测序检查各个组织类型中的这种突变。Yizhak和她的同事们从基因型 - 组织表达（GTEX）计划中开始使用RNA测序数据，由国家健康机构赞助的长期举措，这些卫生研究院已经收集了来自人们捐赠的许多类型正常组织的大量数据谁死于以外的原因癌症。

“识别来自RNA的突变并不容易，因为RNA数据中有很多”噪声“，我们的所有工具都已经开发并调整了DNA中的突变，”癌症基因组计算分析组主任Gad Getz说在广泛的MGH的癌症中心和病理学系生物信息学的病理学教授，以及本文的高级作者。“Keren基于我们的DNA分析工具开发了一种管道，但分析了RNA序列，称为RNA-umect，并添加了将误报的数量减少到非常低的水平。”

通过在GTEX数据库中的488人中分析来自29种健康组织的RNA序列，“我们发现95％的人在其中至少有一个突变的组织，”Getz说。“这意味着每个人都与这些突变的细胞一起出现。”

该团队在他们确定的突变中认识到几种模式与早期研究一致。例如，调查人员发现肺，食道和阳光暴露的皮肤 - 所有组织随着环境暴露的增加 - 具有比其他组织更多的突变（AKA，更高的“突变负担”）。较高的突变率不仅出现了来自老年人的细胞，而且在迅速增殖的细胞类型中出现。

另外，RNA数据显示正常组织含有已知癌基因中含有突变的细胞。“我们预计大多数这些克隆都不会成为癌症;他们长大但可能在某些时候停止，”Getz说。

在工作提出的问题中：这种突变是否会影响努力早期检测癌症？例如，称为“血液活检”的有希望的检测方法搜索从肿瘤细胞脱落的DNA的血液。如果事实证明这一点普通细胞科学家们指出，还将与癌症相关的突变释放出与癌症相关的突变的DNA，这可能使这种检测努力变得复杂化。

该团队迄今为止的研究一直在“宏观”克隆，足以产生可读量的RNA。更一般地在这个研究领域，“看着突变在较小的克隆，下来单身细胞“Getz说，这将非常有趣。”雷斯说。另一个主要挑战是识别各种疾病进展中的早期事件。为此，国家癌症研究所最近发​​起了一种新的大规模研究，对癌前病变称为预癌癌前病变的新大规模研究阿特拉斯。

“在随着年龄的增长增加的其他疾病中显示了体细胞克隆表达，”Getz继续。“例如，血液和心脏病中这些克隆之间存在关联。我们需要研究随老化增加的所有类型的疾病，并测试什么组成部分来自体细胞克隆或其他生物或环境因素。这是一个令人兴奋的研究方向 - 只是了解身体时代的开始。“

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