免费工具简化了癌症研究

每一个细胞都含有大量的蛋白质,其中每个都有一个特定的功能,例如,作为另一个分子的受体或酶催化化学反应。障碍的机制可以严重影响细胞并导致疾病,如癌症,生病的细胞功能从根本上不同于一个健康的细胞。因此很常见药物有一种蛋白质作为它的目标,一个物质抑制或刺激的生产或吸收。同时,有许多批准药物的尝试和测试影响某些疾病但是没有已知蛋白质的目标。等物质,据说操作要么全部或部分未知的机制。

因此科学家们感兴趣的发展中一个相对简单的方法来识别哪些蛋白质受到特定的影响药物。一些这样的方法已经可用,但都有他们的缺点。卡罗林斯卡医学院的研究人员已经利用这些方法来创建一个新工具,提供更加可靠和精确的结果。

研究人员开发了他们的方法通过试验对肺癌细胞治疗56个不同种类的药物。的药物,他们第一次剂量后48小时内杀死一半的细胞(LC50),然后使用这个剂量的药物。一旦一半的细胞死亡,他们检查了每一个细胞的蛋白质组(即。、蛋白质及其丰度)确定蛋白质药物的目标。在进一步的实验中,他们测试了药物在其他细胞乳腺癌和肠道肿瘤,并把结论的程度药物特定的癌细胞或一般的目标。

这些实验的结果中描述检索数据库研究人员创建的,而方法本身是详细的在这篇文章发表在自然通讯。我们的想法是为其他研究人员能够执行类似的实验与其他药物使用相同的模型,从而扩大数据库和更多的目标蛋白质物质。

“我们发现细胞死亡由不同的药物,以不同的方式“说罗马表现怎么样,卡罗林斯卡医学院医学蛋白质组学教授。“不久前,我们过去认为,细胞只能死在三ways-necrosis,细胞凋亡或autophagy-but现在,我们发现至少有13种不同的方式细胞可以死。这种方法可以加速过程的某些部分新药开发或改善我们对现有药物的理解。”