在癌症基因组未被探索的区域发现了新的肿瘤驱动突变
在一项前所未有的全基因组泛癌症分析中，安大略癌症研究所(OICR)的研究人员发现了非编码DNA的新区域，当这些区域发生改变时，可能导致癌症的生长和进展。
这项研究今天发表在分子细胞揭示了疾病进展的新机制，可能导致新的研究途径，并最终更好地治疗诊断测试精准治疗。
尽管之前的研究集中在2%的基因组中编码蛋白质的部分，也就是基因，但这项研究分析了这一问题突变模式人类DNA中大量的非编码区域控制着基因如何以及何时被激活。
“癌症驱动突变在这些通常远离基因的大型非编码区相对罕见，这对系统数据分析提出了重大挑战，”OICR的研究员、该研究的主要作者j
“通过新颖的统计工具和来自1800多名患者的全基因组测序数据，我们发现了可能导致癌症并导致更具侵袭性肿瘤的新分子机制的证据。”
该研究小组分析了每位患者基因组的10万多个部分，重点关注通过三维基因组与基因相互作用的经常被忽视的非编码区域。在发现的30个关键区域中，预计有一个区域在调节已知的抗肿瘤基因中起着重要作用癌症细胞尽管在基因组中与该基因相差超过25万个碱基对。该小组在人类细胞系中进行了CRISPR-Cas9基因组编辑和功能实验，以探索这种非编码的癌症驱动特性地区．
“我们描述了几个可能参与肿瘤发生的非编码区域，但我们只是触及了表面，”Reimand说。“凭借我们的算法和快速增长的患者癌症基因组和表观遗传图谱数据集，我们期待未来的发现能够带来预测患者癌症进展的新方法，并最终找到针对患者疾病或更准确诊断的新方法。”
Reimand的研究小组开发了统计方法在这项研究的背后，让他们免费提供给研究社区使用。这些方法已经与世界各地的其他算法进行了严格的测试。
“研究非编码基因组非常重要，因为这些巨大的部分调节着我们的基因，可以打开和关闭它们。这些区域的突变会导致这些调节开关的异常行为，并可能导致癌症或癌症晚期，”OICR的学生、该研究的第一作者之一Helen Zhu说。“我们已经证明，我们的方法，称为ActiveDriverWGS，可以挖掘这些区域，并确定对癌症生长重要的特定区域。”
“虽然这些候选驱动突变很少见，但我们现在有了第一个实验证据，其中一个突变区域调节了人类细胞系中的癌症基因和途径，”病儿医院(SickKids)的研究助理、该研究的第一作者之一Liis usk
用户评论