众包超级计算项目瞄准冠状病毒
世界各地的人们都在隔离自己,以帮助减缓COVID-19的传播。但是,那些被限制在家中但在线的人还有另一种方式可以加入对抗新型冠状病毒的斗争。在竞相开发针对这种新型大流行病毒的疗法和疫苗的研究项目中,有一个是世界上最大的众包超级计算项目。
由计算生物物理学家格雷格·鲍曼领导,他是生物化学和分子生物物理学在圣路易斯的华盛顿大学医学院,这个项目被称为Folding@home。它依靠志愿者家用电脑的集体力量来完成模拟所需的复杂计算蛋白质动力学.
来自世界各地的志愿者可以在电脑闲置的时候安装一个软件程序来运行这些计算。通常是出于个人经验对于各种疾病,参与者可以选择一个贡献领域,比如促进癌症研究预防阿尔茨海默病,或者现在对抗新型冠状病毒。
例如,鲍曼和他的团队正试图了解COVID-19的刺突蛋白的结构,这是病毒用来感染细胞的物质。这项研究可以揭示阻断这种蛋白质的方法,从而防止感染。自2月底宣布该项目的新重点是冠状病毒以来,Folding@首页鲍曼说,志愿者人数激增,大约有40万个新文件夹加入了这项工作。
他说:“到目前为止,人们的反应是压倒性的,非常棒,但总是有更多有用的科学有待完成。”“了解刺突蛋白在分子反弹和移动时可以呈现的所有不同形状,可以开发出可以阻止它的新药,阻止病毒感染更多细胞。我们将继续以最快的速度扩大研究规模。”
鲍曼分享了可能被认为是COVID-19激增的第一眼蛋白质.它由三种不同的蛋白质组成,它们像3d拼图一样组合在一起。模拟揭示了一个帮助病毒与人类细胞结合并感染它们的口袋。
鲍曼说,本着开放科学和快速分享关于COVID-19的新知识的精神,研究团队将在免费和开放获取的预印本网站(如bioRxiv)上发表研究结果。
更多信息:要加入这一努力,让你的电脑对抗冠状病毒,请访问foldingathome.org.