研究人员寻找新药抗冠状病毒在学校使用电脑在肯塔基州

新型冠状病毒可能在肯塔基州的学区义务教育阶段的学生在家学习,但路易斯维尔大学的研究人员正在使用成千上万的计算机的计算能力在课堂上识别药物来治疗COVID-19。台式电脑是DataseamGrid的一部分,网络电脑安置在教室48肯塔基州的学区作为伙伴关系旨在支持研究的一部分,教育和劳动力发展。

副主任约翰·特伦特博士,基本和转化研究UofL Health-James格雷厄姆•布朗癌症中心进行虚拟筛选发现新癌症药物使用DataseamGrid大容量计算。今天,他的电脑在工作24/7确定最有前途的药物和化合物抗SARS-CoV-2及其疾病、COVID-19。

“在这些空前的时期,我们有资源,我们可能会产生影响快速切换从我们的一些癌症SARS-CoV-2目标目标,”特伦特说。“我们已经非常成功的在做这个癌症了15年。在针对我们使用同样的方法冠状病毒,只是针对不同的蛋白质。"

Dataseam成立于2003年,是由肯塔基州大会提供计算基础设施,人力资源开发和教育机会为学生和员工在肯塔基州的学区。可用计算能力在这些单位工作进行计算机建模计算筛选抗癌药物特伦特的团队和合作者在UofL。

“像很多行业,我们已经改变了我们的技能和基础设施来解决这个问题,”布赖恩说Gupton, Dataseam的首席执行官。“我们总是会有癌症,但至少就目前而言,我们很高兴DataseamGrid在这里特伦特博士屏幕这些药物。”

3月中旬,特伦特和他的团队进入了新的数据到DataseamGrid,连同UofL专门研究计算机在一个双管齐下的方法来匹配的三维模型在SARS-CoV-2蛋白质药物和化合物可能有助于治疗或预防COVID-19。DataseamGrid提供高达80%的计算能力为这些项目。

第一种方法是测试大约2000药物市场上已经和9000个试验性药物和保健品进行毒性检测孤立那些最有可能对病毒有效。

”,最直接的方法,我们正在测试的药物已经被FDA批准或在人类身上进行测试。如果我们发现活动与这些药物,我们可以让他们到病人试验快很多,”特伦特说。“不过,这些药物显然是为别的,他们可能不会有相同的功效的选择性药物。”

发现选择性药物,特伦特的第二方面的研究包括计算模型筛选3700万小分子和化合物在SARS-CoV-2目标蛋白质。这些分子可以用来开发一个新的专门治疗病毒的药物。这一过程需要花费更多的时间,但是,为了获得FDA的批准。

”,首次发现了一个新的、更有选择性的代理更长期。你看12至18个月之前你会考虑测试的一个病人,”特伦特说。“但时间是本质的,所以我们在同一时间做两个事情。”

使用DataseamGrid UofL研究电脑,特伦特和他的团队正在筛选药物和小分子对三维结构四个蛋白在病毒的化合物可能会与蛋白质结合。一个药物干扰这些蛋白质的活动会减少病毒传播的能力。

特伦特开始研究与前两个蛋白质SARS-CoV-2描述:主要的蛋白酶,所使用的一个重要酶病毒病毒蛋白分解,使新的病毒粒子,和蛋白质,三角“旋钮”病毒用来注入宿主细胞。这些峰值旋钮中常见图像表面的病毒。特伦特现在也正在测试药物对两个额外的目标描述最近的蛋白质。

到目前为止,这个过程大约30对SARS-CoV-2药物作为潜在的有效识别。特伦特推荐这些生物测试其他UofL UofL预测医学中心的研究人员生物防御及新兴传染病(CPM)。由肯尼斯·帕尔默博士CPM是仅有的几个实验室在美国测试药物对病毒的能力。测试预计在4月中旬开始。

如果CPM研究者发现这些药物是有效对抗SARS-CoV-2在实验室里,他们可能会转移到下一阶段的测试在动物模型中,测试也可能在CPM进行。

“这计算机建模是一个很好的方法来快速识别最好的实验室检测潜在的候选人,这个策略可能会导致救援为患有COVID-19宜早不宜迟,”Palmer说。

Gupton说很高兴知道DataseamGrid继续支持紧急医学研究尽管学生在家工作。bob88体育平台登录

“具有讽刺意味的是,我们希望尽快回到癌症研究,“Gupton说。“即使学生不在教室,肯塔基州的学区为他们提供指导,技术,互联网接入,甚至食物。地区的Dataseam系统工程师支持大学的工作和k - 12的努力。我们都是骄傲的“数字第一反应者”在肯塔基州的全球斗争的一部分。”

作为Dataseam伙伴关系的一部分,UofL为学生提供学术奖学金每年参加学区谁来大学攻读科学学位,技术,工程和数学。