新工艺来确定潜在COVID-19现有药物治疗
1月下旬,世界看着COVID-19流行越来越不安,密歇根州立大学的实验室,专门从事人工智能和大数据发现治疗癌症,齿轮转向面临未来的挑战。
陈实验室,由本·陈,儿科助理教授和人类发展,药理学和毒理学部门,把自己的专业工作。bob电竞他们开发了一种计算过程识别现有的药物,可以用来对抗SARS-CoV-2病毒无需访问病毒本身。
当一个病毒感染人类细胞,它劫持生殖功能复制和生存。在这一过程中,病毒在宿主细胞的活动影响的基因。每个病毒留下独特的印记在感染的细胞在某种程度上科学的营业税单上有一个基因表达是由现代实验室检测技术。
“我们想要找到一个药物可以阻止宿主细胞基因表达变化,希望能减轻疾病进展和缓解症状,”陈说。
与此同时,全世界的科学家几乎没有了解新病毒和获得活病毒样本有限,他说。基于公开的数据集,陈和他的团队的其他成员的猜测冠状病毒family-SARS和MERS-could近似基因表达的签名的新病毒。
使用fda批准的实验室现有的图书馆或clinically-investigated药物和药物预测管道,一个既定的团队检查了成千上万的潜在候选药物通过复杂的评分方法,等级和排名潜在的候选人对已知的基因表达特征。
“幸运的是,我们发现许多药物可以有效,”陈说。“但我们需要做更多的工作。我们需要生物验证。”
与大学的研究人员合作德州医学分支,陈顶级毒品测试候选人从非洲绿猴肾细胞衍生的,一个常见的细胞株用于毒理学和病毒学的研究。首次接受药物和细胞后被新SARS-CoV-2病毒感染。
“我们发送10药物,结果表明,四种药物能够阻止病毒诱导效应,”陈说。“不幸的是,这些药物,用于治疗癌症,也有毒。但工作的概念。我们的工作过程。现在我们可以找到更多的潜在药物逆转病毒的影响,保持那些毒性药品进一步调查。”
“我很欣赏的科学界已经开放,”陈先生说。“我们知道很少,但是科学家已经提供他们的工作社区,这样我们可以行动。”
研究人员在韩国测试35 fda批准的药物抗病毒功效对实际SARS-CoV-2样本。14阳性药物重叠与陈实验室筛选图书馆和排名也高度的方法。这个数据还外部陈的发现过程的预测能力进行验证。
“我们正努力用最好的科学可以帮助病人,”陈说。
他打算立刻提供他们的工作。“我们需要向公众发布这个数据。其他世界各地的实验室能够从工作中学习,”陈说。“他们可以选择新化合物进行调查。有很多药物筛选。我们无法测试他们。”
这项研究中,“逆转感染宿主基因表达标识使用药物候选COVID-19”出现在bioRxiv。请注意,这项研究中,像许多共享全球大流行期间在预印本bioRxiv等档案,没有经过同行审查。
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