研究样本污水测量六个欧洲国家感染
冠状病毒的传播在斯德哥尔摩和六个欧洲国家正在跟踪通过污水样品k的一个研究小组在斯德哥尔摩皇家理工学院,将于4月底报告业绩。研究人员认为,继续测量将帮助提供冠状病毒感染的早期预警,他们应该回到社区。
意大利heavily-stricken北部地区,以及在西班牙加泰罗尼亚,很多城市在土耳其和印度,以及部分荷兰,都包括在两周一次的抽样,说泽Cetecioglu Gurol,微生物学家和废水工程师k。同时快速反应的努力很快就产生了更多的水样本,包括瑞典第二大城市哥德堡。
协议准备样品,测量冠状病毒RNA和链接阅读水平的数量估计的人口感染,将k提供的所有合作伙伴的国家参与。此外,测序将应用经常跟随任何潜在的COVID-19突变。Cetecioglu Gurol说瑞典以外的废水当局要求研究人员不确定具体的城市废水样品在这些国家。
水中心主任大卫•尼尔森k,贡献了项目的启动资金,说在与斯德哥尔摩供水和污水管理局合作,废水样品被收集在两个主要的治疗计划。他说这个概念提供了一种快速和低成本的方法获得一个广角视图大流行的一个社区。
“我们的方法提供了显著缩短检测时间。首先我们可以快速获得早期警告病毒第二波,”尼尔森说。
k团队将提供结果的一些合作伙伴,同时分析也将由他人。包括Nieuwegein KWR水研究所,荷兰,最近发表的证明概念文件自然显示冠状病毒可能在废水中发现。
“一切都是如此之快,”Cetecioglu Gurol说。“我们宣布抽样后,我们已经收到更多的样品。主要观点是,这是关于公共卫生,而不是研究。
国际合作
“最重要的是合作和分享我们所知道的,并找出别人知道。与样品如果人们想加入我们的项目,或者做自己的分析,我们已经准备好分享。”
Cetecioglu Gurol的研究侧重于从废水生化恢复资源,说下一步是准备样品为了集中污水的冠状病毒。这是更加困难比发现RNA在体液。“废水更为复杂。有很多东西除了病毒外,”她说。
样品然后进行多级过程被称为逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)。这个阶段基本上展开病毒RNA并将其转换成DNA,然后进一步复制有数百万册——足够的定量PCR仪来检测病毒。
k研究者安德斯·安德森和塞西莉亚·威廉姆斯教授是两个测序的科学家参与病毒的遗传物质在生命科学实验室(SciLifeLab)。实验室捐赠工作时间使用设计的诊断化验类似这些临床试验的实验室使用。
最后一步是开发评估工具,基于模拟SARS-CoV-2与公共卫生数据,冠状病毒感染和其他数据废水。
集团同时采样污泥,因为瑞典和其他欧盟国家允许它被转化为农业肥料。
更多信息:传承Mallapaty。污水如何揭示真实规模的冠状病毒爆发,自然(2020)。DOI: 10.1038 / d41586 - 020 - 00973 - x