研究显示了祖先之间的联系和癌症的分子组成

肿瘤的系谱印记问题盘旋在癌症研究自2003年人类基因组计划的完成。在基本的肝癌不同,分子水平在非洲血统的人比欧洲血统的人吗?乳腺癌有不同的基因比印第安人在东亚人?

的研究人员撰写的一篇新论文NCI癌症基因组分析网络,与调查人员合作组织在美国、加拿大和欧洲,提供了迄今最全面的看在祖先的影响正常和癌变组织的分子组成。TCGA利用癌症基因组图谱的数据()涉及10678例患者和33岁的癌症类型,研究人员发现,祖先和数百个基因的变化,但这其中最重要的差别是与特定的组织类型。今天在线发表的研究癌症细胞。

“我们发现患者不同的血统,相对应的分子特性这些差异在很大程度上局限于特定的器官和组织类型,“说Rameen Beroukhim,医学博士,博士,丹娜-法伯和广泛的研究所研究的文章的第二作者安德鲁•Cherniack博士组长丹纳-法伯和Broad研究所。“这说明跟踪ancestry-both在正常和癌症的分子影响tissue-needs tissue-by-tissue方法。”

在研究者的具体的研究结论:

• 从分子的角度来看,非洲血统的人往往有一种不同类型的肾癌比欧洲血统的人。非洲品种明显少了禁用VHL基因突变,为肿瘤刺激新血管的生长。
• 膀胱癌在东亚血统的人画免疫系统反应的迹象显示少于膀胱肿瘤在欧洲背景的人。

在这项研究中,研究者使用各种各样的分子技术,以确定患者的祖先组织样本进行了分析。患者分类主要是欧洲、东亚、非洲、本地/拉丁美洲,或者南亚裔。病人的祖先至少20%的混合被归类为混血后裔。(这些患者被他们的主要祖先subcategorized,如African-Admixed European-Admixed,等等)作为一个群体,患者33癌症类型,其中13进一步分为亚型。

TCGA进行了深入分析每个病人的组织,癌和测试正常细胞的分子特性。其中包括突变(miscopied的DNA片段);DNA甲基化模式(这一过程影响基因是否开启或关闭);信使RNA(分子携带的DNA转录版本,是指示性的基因活动);和微型RNA(核糖核酸的一种形式,帮助或阻碍基因活动)。NCI癌症基因组分析网络调查人员使用这个数据是否这些特性的差异反映了不同的血统。

“我们发现相关祖先差异跨越所有这些特性和在场的数百种不同的基因,”Cherniack表示。”结果,最重要的差异如何影响细胞的功能和与身体的其他部分交互深刻的组织。”Although ancestry affected molecular features in most cancer types, these effects were not shared across cancer types. Molecular differences in lung cancers that were traceable to African ancestry, for example, were not found in breast, pancreatic, or other cancers.

数据还使调查人员问的ancestry-related特性是否正常细胞携带到癌变的版本cells-whether肺细胞的分子特性例如,在欧洲提取的人也发现了肺癌症细胞这样的人。他们发现这是压倒性的。“大多数正常组织的差异具体血统的人一再癌症中,“Beroukhim表示。此外,有证据表明,其中的一些差异可能导致某些癌症的发展相似背景的人。

从患者获得数据的混合血统被证明是一种资产,该研究的作者说。调查人员进行了初步分析其祖先是至少80%的病人在一个五的组。后,他们在一个类似的混血人口数据的分析。“当这两个分析的结果jibed-when分子差异具体祖先组织还出现在一个病人的祖先是一个组合的集团和另一些特别的有力证据的有效性最初的发现。”研究的联合作者之一说,剑Carrot-Zhang,博士,博士后研究员Meyerson集团丹纳-法伯和广泛。“混合背景的病人是一个特别强大的群的祖先在癌症研究分子的影响,“Beroukhim表示。“它帮助我们缩小区域的基因组造成这些差异。”

研究显示的综合性质的一些缺点之前努力种族和血统与分子细胞的元素。首先,这样的研究倾向于把各种亚型的癌症在一起,Beroukhim说,尽管某些亚型在某些祖先比其他人更常见。的一些技术用来解剖分子特性也可能扭曲先前的研究的结果。

研究人员尚未确定分子差异祖先源于环境因素和遗传因素。然而,他们识别祖先相互之间的遗传差异可以解释他们的发现。

“我们的发现指出需要更多样本不同血统进行真正的综合祖先分析,特别是正常组织,“Beroukhim言论。“这项研究代表了在这个方向上迈出的重要一步。”