发现脑瘤背后基因的新方法

乌普萨拉大学的研究人员开发了一种识别功能突变的方法及其对与胶质母细胞瘤 - 一种恶性脑肿瘤相关的基因的影响，其预后非常差。该研究发表在基因组生物学。

这人类基因组包括近22,000基因。许多研究探索了我们DNA中产生蛋白质的近2%。对于不编码蛋白质的那98%，我们所知甚少。然而，这些非编码区域包含重要的信息，并调节基因是否在不同组织、不同发展阶段和癌症等疾病中活跃。

癌症是由突变这导致不受控制的细胞分裂。最具侵略性的癌症类型之一是胶质母细胞瘤，一种脑肿瘤的形式，预后非常差。关于非编码区如何突变胶质母细胞瘤的突变是众所周知的。解决这个问题知识差距，乌普萨拉大学的研究人员在胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织中对DNA进行了全基因组测序，并分析了鉴定的突变。

“我们的关键任务之一是识别与之相关的功能突变监管要素乌普萨拉大学免疫、遗传和病理学系的Karin Forsberg-Nilsson教授说:“这是一种非常有效的方法。

研究人员认为，哺乳动物在进化过程中保持不变的DNA序列可能具有重要的功能。因此，他们将他们发现的数千种突变与突变所在基因区域的进化保护信息相结合。

“我们选择专注于可能影响的最佳保存的遗传区域中的突变子集基因调控乌普萨拉大学医学生物化学和微生物学系以及美国布罗德研究所的kerstin - lindblado - toh教授说。

研究人员使用基因SEMA3C验证了结果，部分原因是它们在该基因附近的非编码调节区中发现了大量突变，部分是因为先前的发现，另外的发现，SEMA3C与癌症预后较差。

“我们研究了非编码区域的突变如何影响SEMA3C的功能和活性。我们的结果表明，SEMA3C附近的一个特定的、进化上保守的突变，破坏了某些蛋白质的结合，这些蛋白质的任务是结合基因并调节它们的活动，”Forsberg-Nilsson说。

该研究还确定了有关区域中200多个非编码突变的其他基因。这些可能具有调节潜力，从而进一步增加与脑肿瘤发展相关的基因数量。

“我们的成果证实了非编码区遗传改变与其生物学功能和疾病病理学之间的关联的重要性，”Forsberg-Nilsson总结道。

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