跟踪的肽
使用新开发的方法,维尔茨堡大学的研究人员在维尔茨堡大学医院的合作,能够识别成千上万的特殊肽细胞表面的第一次。他们能够表明,这些所谓的神秘肽标志着一个重大的肿瘤细胞的比例。这些研究结果可能为癌症免疫疗法提供了一个新的起点和发表在著名的杂志上癌症免疫学研究。
几乎所有的细胞人体的细胞表面的蛋白质片段,所谓的人类白细胞抗原或HLA肽,扮演着重要的角色免疫反应。如果免疫系统检测到外国HLA肽,如病毒多肽在感染病毒的细胞或肿瘤细胞突变肽,t细胞消除相应的细胞。HLA的完整肽在细胞被称为细胞´s immunopeptidome。
新方法使首次综合分析
除了通常的HLA肽,还有神秘的HLA肽。这些都是来源于特定的RNA序列,不包含信息为一个特定的蛋白质的情况通常是这样。在过去的几十年里,只有少数的HLA肽已确定,因为他们非常小和快速退化的细胞。另一方面,缺乏高效的计算机算法分析。
在一个全新的方法中,维尔茨堡科学家现在有几个相结合分析方法特别适合小肽。“使用一种新颖的生物信息学方法由我们,我们首次能够识别成千上万的神秘的HLA immunopeptidomes肽的各种肿瘤如黑素瘤、乳腺癌,”安德烈亚斯Schlosser博士解释道,研究组长Julius-Maximilians-Universitat Rudolf Virchow中心(JMU)维尔茨堡在巴伐利亚,德国。
新的生物信息学方法是完全基于数据质谱分析的方法确定分子如肽的质量。这使得它可以系统地,全面确定神秘HLA肽。此外,可以阐明细胞和神秘的肽在多大程度上存在:“我们能够表明,神秘的HLA肽组成的immunopeptidomes肿瘤的重要组成部分,“弗洛里安·艾博士教授解释说,在JMU病毒学研究所的组长。
有效点的攻击免疫系统
从个人研究已经知道神秘的肽可以引发自身免疫反应,如在1型糖尿病以及对肿瘤细胞的免疫反应。新分析提供证据表明,某些神秘的HLA肽是专门在肿瘤细胞中找到。这种肿瘤特异性的HLA肽可能因此被证明是有价值的目标结构对癌症免疫疗法。维尔茨堡大学的科学家和维尔茨堡大学医院已经检查确认多肽的选择来决定它们是否适合作为癌症的免疫治疗的目标。
感染病毒的细胞也存在神秘的HLA肽,可以作为疫苗的目标结构。与他们的新方法,研究人员因此手头有一个有效的工具来了解更多关于神秘的一般功能和形成肽。“我们希望我们的生物信息学方法将为我们提供一个更好的理解的自体免疫反应和免疫反应对肿瘤细胞和病毒感染细胞,”Schlosser说。
更多信息:弗洛里安·et al,识别的神秘HLA-I immunopeptidome,癌症免疫学研究(2020)。DOI: 10.1158 / 2326 - 6066. -新闻- 19 - 0886