生物学家使用基因组数据库调查癌症细胞

佛罗里达州立大学的生物科学教授大卫·吉尔伯特是使用最新的关于人类基因组的信息作为指导,以更好地了解癌症。

吉尔伯特和他的前苏联的同事是一个团队的一部分,而不同癌症正常人类的细胞类型到一个数据库细胞使用他所开发的一种新方法,可以确定癌症的细胞类型派生。通过比较不同癌症细胞正常细胞的集合,他们能够告诉癌症大部分是密切匹配不同的细胞类型。

“癌症细胞来自你身体里的细胞,但他们已经改变了,”吉尔伯特说。“知道他们来自细胞类型尤为重要,在评估一个新的肿瘤复发患者是否来自于原发肿瘤或癌症完全是一个新的。”

他们的工作发表在自然通讯,是一个大型的系列出版物的国际努力了解人类基因组作品,由美国国立卫生研究院资助,称为DNA序列元素的百科全书(编码)。因为只有1%的人类DNA编码任何已知的蛋白质,其余的功能的理解,我们的基因组是一个巨大的挑战。

吉尔伯特和他的同事们也贡献较大的编码出版,发表在《自然》总结的最新周期编码资金的努力。本研究的亮点是近一百万个元素的映射人类基因组覆盖8%的基因组,调节基因。也就是说,他们决定和身体组织的基因表达。

“有机体的复杂性不是数量的蛋白质编码基因,”吉尔伯特说。“这是在这些基因的结合。我们几乎相同数量的基因蠕虫和果蝇,但我们在更复杂的组合表达它们。”

他的实验室增加replication-the自身的DNA复制过程。

“人们通常不认为复制的东西会受到不同的管制在不同的细胞类型,因为DNA在所有细胞都是一样的,”他说。“然而,这不仅仅是DNA复制。相反,调节DNA的所有组件的染色体DNA复制时是完全拆除,重新组装。我们已经表明,与复制的DNA片段的顺序是独一无二的,每一个细胞类型和病变细胞也不同。它甚至可以是唯一的特定病人的癌症。”

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