试图更有效研究不同微生物组的研究人员

每个人的微生物组都不同 - 那么您如何有用学习?
学分:杜克大学

我们知道纤维对我们有好处,并且是我们饮食的重要组成部分。在饮食中获得更多纤维的一种方法是服用纤维补充剂,如果我们服用纤维补充剂,我们的微生物组就会爱我们。

但是纤维补充剂确实对我们有所作为?事实是每个人的微生物组都不同。我们每个人的微生物组中有100种不同类型的细菌,一个人的细菌与另一个人的细菌有很大不同。无关的人不超过相同细菌菌株的30%。

微生物组中发现的各种细菌菌株使研究变得具有挑战性。为了将所有细菌分离出一个人的微生物组,可能需要两个月的时间,这是在进行这些细菌的任何实验之前。

为了解决这个问题,劳伦斯·戴维(Lawrence David)以及现在的前大卫实验室成员Max Villa和Rachael Bloom开发了称为培养物和测定肠道微生物功能的数百个不同微生物。这使他们可以在一天内分析个体微生物组中的数十种细菌物种。布卢姆说:“我们知道肠道微生物组在人类健康中非常重要。”“有一种方法可以衡量某人的微生物组如何应对治疗方法(无论是药物,益生菌还是益生元)真的很重要。”他们的作品于6月30日在MSYSTEMS出版。

该平台使用气泡分离细菌。为了制作气泡,它们将细菌与水和油混合。有点像沙拉调味料。当您摇动沙拉调味料以使油和水混合混合时,您会产生气泡,因为水和油不会混合。在Micdrop中,这些气泡封装了细菌。戴维说:“因为气泡是分开的,它们实际上最终像小培养皿一样。”然后,团队可以在这些气泡中种植细菌,并通过DNA测序仪运行产生的培养物质,以发现气泡中的细菌以及多少种细菌。

作为概念证明,他们测量了细菌能够消化超市可用的各种饮食补充剂。“我们不知道如何会影响不同的人,”戴维说。“我们想知道每个人是否都有细菌可以消费如果是这样,他们有很多还是一点?”

他们使用Micdrop来回答这个问题。他们给了微生物专门设计的。只有能够在该饮食上生长的微生物才会繁殖。维拉说:“然后,我们改变了微生物培养基,看看哪些微生物可以降解这种新的饮食纤维。”他们测试的九个人中的每一个都有看起来可以消化补充剂的细菌,但是这些细菌的数量多变。

维拉说:“传统上,微流体学已经在工程实验室里有了家,但是我们的技术对于更广泛的研究人员来说很简单。”

后续研究将进一步分析该工具,以查看它是否可以真正预测谁将对给定的补充剂做出最好的反应。戴维说:“我有一天可以设想的是能够品尝一个人的微生物组并在许多食物和补品中进行筛选,并使用它来告知和帮助个性化某人的饮食。”


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由...提供杜克大学
引用:试图更有效地研究不同微生物组的研究人员(2020年7月2日)2021年6月17日从//www.pyrotek-europe.com/news/2020-07-differing-microbiomes-effectively.html
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