面料体DNA在人类癌症中常见，驱动患者结果不佳

根据a，位于含有导致癌症的面料瘤性DNA中的基因的繁殖在具有导致癌症的可能导致癌症的患者结果不佳自然遗传学2020年8月17日出版的研究人员由一支研究人员组成，包括vineet Bafna教授和加州大学圣地亚哥和杰克逊实验室教授Roel Verhaak博士。

这是第一次研究表明，这些全面核糖瘤菌（ECDNA）基因的乘法 - 一种称为ECDNA癌基因扩增的现象 - 存在于广泛的癌症中瘤类型。研究人员发现ecdna是一个常见的事件人类癌症，至少在14％的人类肿瘤中发生，具有远远高，频率远远较高的癌症，包括胶质母细胞瘤，肉瘤，食管，卵巢，肺，膀胱，头部和颈部，胃和许多其他频率。研究结果表明，ecdna在癌症中发挥着关键作用。

“我们还发现癌症具有ecdna的患者的生存率明显较短癌症患者，即使被肿瘤类型分组，谁的肿瘤也是由其他分子病变的驱动的，“Mischel博士说，其中一名研究的作者和UC San Diego医学院的杰出教授，以及Ludwig癌症研究所的成员。

较短的整体存活引发了癌症患者的肿瘤由ecdna驱动的可能性可能不对当前疗法反应，并且可能需要新的治疗形式。研究人员希望这些发现将适用于具有EcDNA驱动癌症的个体的强大抗癌疗法的发展。

“本研究为癌症eCDNA的分子流行病学提供了一个新的窗口，为纵向学习患者提供了一个独特的机会，以更好地了解他们如何以及为什么对待治疗，”米奇尔博士说。

研究人员观察到，ECDNA扩增发生在许多类型的癌症中，但不在正常组织或全血中，并且最常见的复发性癌基因扩增经常出现在ECDNA上。值得注意的是，在25的25中发现了基于EcDNA的扩增圆形标记癌症类型在许多癌症中分析，并且在许多癌症中被认为是最具侵略性的组织学类型，例如胶质母细胞瘤，肉瘤和食管癌。

“似乎癌症似乎已经拉了一个古老的进化伎俩。癌症和周围的监管区域从它们的染色体约束中解开，驾驶高癌基因拷贝数，加速肿瘤演化，有助于治疗抵抗力，并赋予迅速改变其基因组的能力据Mischel说，响应于迅速改变的环境，从而加速肿瘤演化和促进治疗抵抗力。“

为了实现这一发现，研究团队在癌症基因组地图集（​​TCGA）中的3,200多个肿瘤样本和全基因组（PCAWG）的泛癌分析中，对全基因组测序数据的密集计算分析使用了全基因组测序数据，总共超过400兆字节原始测序数据，观察EcDNA扩增对患者结果的影响。

“我们开发了一种称为Axplicon Architect的强大计算方法，它根据三个关键特征，高拷贝数和”断点重用“识别EcDNA，即UC San Diego计算机科学部的教授工程。

Mischel和Bafna博士是无限生物的Cofounds，该公司在开发侵略性癌症中的创新新疗法，该公司开发针对侵袭性癌症的全组织瘤（ECDNA）。

“这些结果指出了迫切需要疗法，可以瞄准eCDNA并干扰其促进侵略性癌症生长，抵抗和复发的能力，”无限生物的首席技术官Jason Christiansen说，杰森克里斯汀说。

什么是ecdna？

含有圆弧菌DNA或ECDNA是不同的DNA含有官能基因的圆形单位，其位于细胞的染色体外，可以制造许多副本。ECDNA在癌细胞中迅速复制，导致大量的癌基因拷贝，一种可以在细胞分裂期间以不对称方式传递给子细胞的特征。癌细胞具有上调或下调位于EcDNA上的癌基因，以确保在选择性压力下存活，包括化疗，靶向治疗，免疫疗法或辐射，使eCDNA成为其中一种癌症细胞的复发和治疗抗性机制。EcDNA在健康的细胞中很少见到许多实体肿瘤癌症。它们是最具侵略性和难以治疗的癌症的关键驱动因素，特别是那些以癌细胞的高拷贝数扩增为特征的癌症。

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