568个基因被鉴定为可能引发癌症

对来自66种癌症的28000个肿瘤的基因组分析，已经确定了568个癌症驱动基因

这项研究由巴塞罗那研究所生物医学基因组学实验室进行，允许对整合肿瘤基因组学(IntOGen)平台进行重大更新，旨在识别突变癌症司机的基因。

发表在自然评论癌症的研究结果提供了迄今为止最完整的癌症驱动基因纲要的快照。

癌症是一组疾病，其特征是由突变和细胞基因组的其他改变引起的细胞不受控制的生长。一个肿瘤可以有数百到数千种突变，但只有少数突变对其致瘤能力至关重要。这些关键突变影响癌症驱动基因的功能。找到这种癌症驱动突变的基因是癌症研究的主要目标之一癌症研究．

来自IRB巴塞罗那生物医学基因组实验室的研究人员，由ICREA研究员Núria López-Bigas领导，对66种癌症中的约28000个肿瘤进行了广泛的计算分析，并确定了568种癌症驱动基因。这些关键基因在调节细胞生长、细胞周期和DNA复制等方面发挥着特定的作用。这些基因的突变，赋予恶性细胞迅速和无休止地繁殖的能力，逃避免疫系统和其他防御系统，扩散和入侵其他组织，改变环境以使其受益，以及其他能力。

López-Bigas说:“驱动基因的纲要为临床和基础研究领域的癌症研究人员提供了至关重要的知识，它对临床决策具有重要影响。”“例如，如果我们知道肿瘤的致瘤能力依赖于一种特定的蛋白质，一种被批准的靶向治疗——即。她补充说:“肿瘤医生可能会使用抗体或其他抑制剂来治疗患者。”

大多数癌症驱动基因都是高度特异性的

通过对568种癌症驱动基因的鉴定，研究人员观察到大多数基因具有高度特异性，其突变只能引发少数几种肿瘤类型。然而，有一小群人，占已确定癌症患者的不到2%，他们非常多才多艺，可以引发20多种不同类型的癌症。“虽然我们知道癌症驱动基因自首次被发现以来具有不同程度的特异性，但有了这个纲要的快照，使我们能够以公正的方式解决这个问题，”生物医学基因组学实验室的研究助理Abel González Perez说，他也领导了这项研究。

其他研究小组先前的研究表明，癌症是由平均四个癌症驱动基因的关键突变引起的。某些类型的癌症，其特征是突变数量很少，这些基因中只存在一个突变，而其他通常存在许多突变，如结直肠癌和子宫肿瘤，则存在多达10个突变。其他基因组改变，如结构变异、基因拷贝数的改变和影响基因组非编码区域的突变也有助于肿瘤的发生。

积极选择作为指标

基因中出人意料的突变模式，不同于中性状态下的预期，构成了它们处于中性状态的信号积极的选择在肿瘤发生。IRB巴塞罗那的研究人员利用这些积极选择的信号来识别突变驱动基因。为了计算这些信号，需要对所有基因在中性条件下的突变积累进行精确的建模，这样就可以很容易地发现任何基因与预期模式的偏差。

积极选择的信号被用来识别突变驱动基因，例如，在一个基因中异常高的突变数量或一个意想不到的分布突变沿着基因序列。在这篇发表在杂志上的最新文章中自然评论癌症，研究人员提出了开放获取IntOGen平台的更新，包括在所有突变驱动程序上计算这些信号的值基因．“随着越来越多的肿瘤测序数据被发布到公共领域，IntOGen平台为系统更新纲目提供了理想的基础设施，”生物医学基因组学实验室博士后研究员Francisco Martínez-Jiménez说。

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